07 2020 档案
摘要：很多人问过我敏感性分析的问题，说明大家对敏感性分析普遍是有疑问的，我之前的推文中也没有详细的讲过，因此决定写这一篇补充一下敏感性分析的工作。 什么是敏感性分析 敏感性分析定义：敏感度分析是研究数学模型或系统(数值或其他)输出中的不确定性如何在其输入中被分配到不同的不确定性来源 ——摘自维基百科。 我
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摘要：本周最新文献速递 一 文献题目： Multi-faceted epigenetic dysregulation of gene expression promotes esophageal squamous cell carcinoma 不想看英文题目： 基因表达的多方面表观遗传失调促进食管鳞状细胞
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摘要：本周最新文献速递 一 （将不完全相似的表型进行荟萃分析，找出新的遗传位点，这是我第二次见到文献进行这种操作，一个新思路，值得借鉴） 文献题目： Multivariate genomic scan implicates novel loci and haem metabolism in human a
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摘要：file1的文件如下所示： a rs1 b rs2 c rs4 file2的文件如下所示： a 0.170721 -1.82031 0.0690841 rs1 b 0.0803412 -1.01669 0.309605 rs2 c 0.21245 0.22964 0.81843 rs3 d 0.07
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摘要：本周最新文献速递 一 文献题目： Multi-method Genome- And Epigenome-Wide Studies of Inflammatory Protein Levels in Healthy Older Adults 不想看英文题目： 健康老年人炎症蛋白水平的全基因组和表观基因
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摘要：MR-PRESSO是18年发在Nature Genetics上的一个检验水平基因多效性的方法Detection of widespread horizontal pleiotropy in causal relationships inferred from Mendelian randomizat
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摘要：如果想将基因型转化为0,1,2 可以使用命令：plink --bfile file --recodeA --out recodefile 如果想将基因型转化为0,1 可以使用命令：plink --bfile file --recodeD --out recodefile 如果想将基因型同时转化为0,
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摘要：安装R包时发生如下报错ERROR: configuration failed for package ‘gmp’ 用conda安装conda install -c conda-forge r-gmp即可解决这个报错。
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摘要：一周前Cancer Res (IF: 8.378) 新发了一篇文章“LDtrait: An Online Tool for Identifying Published Phenotype Associations in Linkage Disequilibrium” 看文献名很好理解，就是通过输入R
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摘要：本周最新文献速递 一 文献题目： Assessment of Polygenic Architecture and Risk Prediction Based on Common Variants Across Fourteen Cancers 不想看英文题目： 基于常见变异对十四种癌症进行多基因架
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摘要：使用p1 <- prcomp_irlba(beta, n=20)进行PCA计算，一直报错： Error in (function (A, nv = 5, nu = nv, maxit = 1000, work = nv + 7, reorth = TRUE, : BLAS/LAPACK 例行程序'D
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