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橙子牛奶糖
简介:陈文燕,本科暨南大学,中科院博士。 欢迎关注微信公众号“bio生物信息”,进群与众多生信同行一起讨论学术问题。私信不回,有问题请在文章下面评论。
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2020年5月26日
甲基化数据QC:使用甲基化数据计算样本间的相关性
摘要: 样本间的相关性,可以反映公司加样时是否存在重复加样的错误。 下面简要介绍一下如果利用甲基化数据计算样本间的相关性 ###1、提取甲基化探针的snp位点、CpG的beta值 下面用的示例文件是minfi包自带的。 如果是自己的数据,那么提取甲基化snp位点用的是没有经过过滤的原始数据。 首先,安装:
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posted @ 2020-05-26 19:27 橙子牛奶糖
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