2020年5月19日
在甲基化ChAMP包中加入协变量
摘要： 最近在分析甲基化数据，发现ChAMP包的输入端是beta（甲基化数据）和pheno（表型数据），找不到校正协变量（比如年龄、性别、批次等）的输入端。 如下代码所示： 查了一下ChAMP包的代码，发现ChAMP包调用的是limma函数。 因此，这事就比较好解决了。 只需要在原代码的基础上修改model 阅读全文
posted @ 2020-05-19 22:24 橙子牛奶糖 阅读(1320) 评论(0) 推荐(1) 编辑