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橙子牛奶糖
简介:陈文燕,本科暨南大学,中科院博士。 欢迎关注微信公众号“bio生物信息”,进群与众多生信同行一起讨论学术问题。私信不回,有问题请在文章下面评论。
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2020年5月19日
在甲基化ChAMP包中加入协变量
摘要: 最近在分析甲基化数据,发现ChAMP包的输入端是beta(甲基化数据)和pheno(表型数据),找不到校正协变量(比如年龄、性别、批次等)的输入端。 如下代码所示: 查了一下ChAMP包的代码,发现ChAMP包调用的是limma函数。 因此,这事就比较好解决了。 只需要在原代码的基础上修改model
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posted @ 2020-05-19 22:24 橙子牛奶糖
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