08 2019 档案

查询、下载GWAS目录数据的R包(gwasrapidd)
摘要：目前GWAS方向发了很多文献，但是并没有一个很完善的R包对这些文献的数据进行汇总。 接下来推荐的这个是最新发表的GWAS数据汇总R包​。看了一下功能齐全，但是数据不是收录的很齐全​。 下面具体讲一下。​ 在R上安装 查询是否有发表关于自身免疫性疾病的文章 提取显著信号位点信息 获取含有rs12752 阅读全文
posted @ 2019-08-28 21:26 橙子牛奶糖 阅读(2960) 评论(0) 推荐(1) 编辑
LD SCore计算基因多效性、遗传度、遗传相关性(the LD Score regression intercept, heritability and genetic correlation)
摘要：这篇文章是对之前 "啊啊救救我，为何我的QQ图那么飘（全基因组关联分析）" 这篇文章的一个补坑。 LD SCore除了查看显著SNP位点对表型是否为基因多效性外，还额外补充了怎么计算表型的遗传度和遗传相关性。 1 下载、安装ldsc 2 安装ldsc依赖的环境 3 测试是否安装成功 如果安装成功，输 阅读全文
posted @ 2019-08-08 15:21 橙子牛奶糖 阅读(9077) 评论(36) 推荐(2) 编辑

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