2019年3月6日
GWAS群体分层 (Population stratification)：利用plink对基因型进行PCA
摘要： 一、为什么要做祖先成分的PCA? GWAS研究时经常碰到群体分层的现象，即该群体的祖先来源多样性，我们知道的，不同群体SNP频率不一样，导致后面做关联分析的时候可能出现假阳性位点（不一定是显著信号位点与该表型有关，可能是与群体SNP频率差异有关），因此我们需要在关联分析前对该群体做PCA分析，随后将 阅读全文
posted @ 2019-03-06 17:07 橙子牛奶糖 阅读(9533) 评论(2) 推荐(2) 编辑