2019年1月25日
GWAS: 曼哈顿图，QQ plot 图，膨胀系数（ manhattan、Genomic Inflation Factor）
摘要： 画曼哈顿图和QQ plot 首推R包“qqman”，简约方便。下面具体介绍以下。 一、画曼哈顿图 1、准备包含SNP, CHR, BP, P的文件gwasResults（如果没有zscore可以不用管），如下所示： 2、上代码，如下所示： 如果觉得不够美观，考虑添加一下参数： 二、画 QQ plot 阅读全文
posted @ 2019-01-25 11:27 橙子牛奶糖 阅读(17137) 评论(18) 推荐(2) 编辑