10 2018 档案

用popart构建常染色体单倍型网络（Autosomal haplotypes network construction with popart）
摘要：1）将vcf转化为plink格式，假定输入的vcf文件名为：17893893-17898893.vcf,也可以参考链接：将vcf文件转化为plink格式并且保持phasing状态 2) 用PLINK确定要研究的位点是否处于连锁的状态；生成blocks和blocks.det两种后缀格式文件； 以上结果 阅读全文
posted @ 2018-10-30 19:22 橙子牛奶糖 阅读(6457) 评论(4) 推荐(0) 编辑
R: 修改镜像、bioconductor安装及go基因富集分析
摘要：1、安装bioconductor及go分析涉及的相关包 在这一步经常出现以下报错： 报错类型1：Warning message: In file(filename, "r", encoding = encoding) : InternetOpenUrl failed: '操作超时'。 这类报错的解决 阅读全文
posted @ 2018-10-25 11:49 橙子牛奶糖 阅读(4393) 评论(0) 推荐(0) 编辑
R语音：解决cor.test报错的 'y'必需是数值矢量
摘要：'y'必需是数值矢量，产生该类报错可能是含有NA值。 只需要在该数值上加入as.double函数即可。见下命令： 阅读全文
posted @ 2018-10-11 11:07 橙子牛奶糖 阅读(6078) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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