摘要：
1、bcftools提取指定区段的vcf文件 下载安装bcftools 见如下命令： 注意：输入的vcf以gz格式存在，不然会报错：Failed to open 1000Genomes.vcf: not compressed with bgzip 如何将vcf生成gz格式，见这篇文章bcftools 阅读全文
摘要：
对于某些特殊vcf，想去除没有变异的基因型（主要形式为0|0或者0/0），则需要用到GATK的--excludeNonVariants参数，命令行如下： 参考链接： https://www.biostars.org/p/203809/ https://software.broadinstitute. 阅读全文
摘要：
1、下载安装bcftools。 2、准备样本ID文件，这里命名为samplelistname.txt，一个样本一行，如下所示： sample1 sample2 sample3 3、输入命令： 参考链接： https://www.biostars.org/p/184950/ https://samto 阅读全文