04 2018 档案

GWAS研究可利用的数据库（20211008更新）
摘要：1、列表包括数据库名称、表型、是否能下载到基因型（genotype）、是否能下载到GWAS结果文件（P值、效应值、SNP位点）。目前收集到的有如下： 参考到这些数据库的文献：Genome-wide association study identifies 74 loci associated wit 阅读全文
posted @ 2018-04-28 20:03 橙子牛奶糖 阅读(23804) 评论(1) 推荐(2) 编辑
文献笔记：Genome-wide associations for birth weight and correlations with adult disease
摘要：该文献纳入了EGG（Early Growth Genetics Consortium）和UK biobank两大数据库，分为欧洲祖先和非欧洲祖先群体。这两个数据用到的样本量分别如下： Early Growth Genetics Consortium（网址：http://egg-consortium. 阅读全文
posted @ 2018-04-28 19:27 橙子牛奶糖 阅读(947) 评论(0) 推荐(1) 编辑
snpeff注释变异（variants）
摘要：1、进入网站http://snpeff.sourceforge.net/，下载snpeff: 2、解压、安装 解压后出现如下图： 3、注释变异： 注：由于snpeff是一个基于java的软件包，需要在有java的环境中运行，因此使用此工具包前先安装好java，如果已经安装过java，则忽略此。 结果 阅读全文
posted @ 2018-04-27 15:13 橙子牛奶糖 阅读(981) 评论(0) 推荐(0) 编辑

点击右上角即可分享
微信分享提示