2017年10月28日
外显子分析弹错解决方案：Invalid command line: Cannot process the provided BAM/CRAM file(s) because they were not indexed.
摘要： 出现这种问题说明bam/cram文件没有进行index. Samtool能解决这个问题，以bam文件为例，输入以下命令行即可解决问题： 阅读全文
posted @ 2017-10-28 17:56 橙子牛奶糖 阅读(576) 评论(0) 推荐(0) 编辑
外显子分析弹错解决方案：Exception in thread "main" picard.PicardException: New reference sequence does not contain a matching contig for NC_007605
摘要： 最近从公共数据库下载了一堆bam文件和reference 基因组文件，重新分析外显子流程时，跑出了“Exception in thread "main" picard.PicardException: New reference sequence does not contain a matchin 阅读全文
posted @ 2017-10-28 14:50 橙子牛奶糖 阅读(896) 评论(0) 推荐(0) 编辑