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橙子牛奶糖
简介:陈文燕,本科暨南大学,中科院博士。 欢迎关注微信公众号“bio生物信息”,进群与众多生信同行一起讨论学术问题。私信不回,有问题请在文章下面评论。
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2017年9月20日
plink, vcftool计算等位基因频率(allele frequency,vcf)
摘要: 计算等位基因频率有两种方式,第一种用vcftool计算: 很简单的一个命令行,file.vcf指的是你要输入的vcf文件,--freq表示计算等位基因频率,--chr后面的1表示你要计算的区域在1号染色体,当然,你也可以选择你想计算的染色体区域,filefreq指的是输出的文件名。 结果如下图所示:
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posted @ 2017-09-20 23:17 橙子牛奶糖
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