2017年6月25日
vcf文件（call variants得来的）怎么看变异是纯合还是杂合的
摘要： 如下图片所示： 对于位置为48245131的allele来说，REF为A，ALT为C 想确定变异到底是纯合还是杂合，即两条染色体是否同时发生了变异，则看GT，GT对应的数值为0/1，说明该变异为杂合； 如果GT对应的数值为0/0，说明该变异为纯合。 阅读全文
posted @ 2017-06-25 18:15 橙子牛奶糖 阅读(2450) 评论(2) 推荐(1) 编辑
出现Exception in thread "main" java.lang.UnsupportedClassVersionError: org/broadinstitute/gatk/engine/CommandLineGATK : Unsupported major.minor version 52.0问题解决方案
摘要： 在做外显子分析Indel Realigner时，弹出以下错误： Exception in thread "main" java.lang.UnsupportedClassVersionError: org/broadinstitute/gatk/engine/CommandLineGATK : Un 阅读全文
posted @ 2017-06-25 15:36 橙子牛奶糖 阅读(1312) 评论(0) 推荐(0) 编辑