01 2017 档案

喝芦荟酸奶能不能使皮肤变好？
摘要：芦荟一直以来作为众多女性的必备护肤品而广受欢迎。然而其护肤效果一直饱受争议，甚至背负“渣男”称号。看着很有用，实际烂心大苹果。芦荟酸奶，作为一种新的饮品，是否具有芦荟护肤特性呢？ 最近日本一个团队发表了一篇文章《Effects of Aloe Sterol Supplementation on Sk 阅读全文
posted @ 2017-01-19 17:44 橙子牛奶糖 阅读(281) 评论(0) 推荐(1) 编辑
merge函数：R语言，根据相同的列或ID合并不同的文件
摘要：一般Excel就能实现根据相同的列或ID合并不同的文件，但对于大文件来说，比如几十个G的数据量，用Excel处理，不仅耗时，而且还会使电脑崩溃。R语言的优势就体现在这里了，处理大文件相当快。 注意：使用merge函数合并文件时，要把文件转化为数据框格式（data.frame） 阅读全文
posted @ 2017-01-18 17:55 橙子牛奶糖 阅读(7841) 评论(0) 推荐(0) 编辑
R语言画棒状图（bar chart）和误差棒（error bar）
摘要：假设我们现在有CC,CG,GG三种基因型及三种基因型对应的表型，我们现在想要画出不同的基因型对应表型的棒状图及误差棒。整个命令最重要的就是最后一句了，用arrows函数画误差棒。用到的R语言如下： 效果图如下： 阅读全文
posted @ 2017-01-18 17:04 橙子牛奶糖 阅读(4551) 评论(0) 推荐(0) 编辑
去除外显子低质量reads时弹出错误“Invalid quality score value (char '#' ord 35 quality value -29) on line 4”和“Invalid quality score value (char '.' ord 46 quality value -18) on line 12”的解决方法
摘要：楼主跑以下程序时分别弹出了“fastq_quality_filter: Invalid quality score value (char '.' ord 46 quality value -18) on line 12”和“fastq_quality_filter: Invalid quality 阅读全文
posted @ 2017-01-10 16:20 橙子牛奶糖 阅读(593) 评论(0) 推荐(0) 编辑
外显子分析：cutadapt，去除序列adapter详细解析
摘要：外显子测序时带有adapt接头，因此我们需要去除adapt接头，cutadapt的作用是去除adapt接头，一般用到如下命令： “-a”参数表明后面跟着的“AACCGGTT”是我们想要去除的adapt接头，如果你的外显子接头为其他序列，请将“AACCGGTT”改为你想去除的adapt接头； “-o” 阅读全文
posted @ 2017-01-09 15:05 橙子牛奶糖 阅读(2172) 评论(0) 推荐(1) 编辑

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