11 2016 档案

全基因组关联分析（Genome-Wide Association Study，GWAS）流程
摘要：全基因组关联分析流程： 一、准备plink文件 1、准备PED文件 PED文件至少有六列，内容如下： Family ID Individual ID Paternal ID Maternal ID Sex (1=male; 2=female; other=unknown) Phenotype(-9 阅读全文
posted @ 2016-11-23 21:47 橙子牛奶糖 阅读(23655) 评论(7) 推荐(3) 编辑
linux提取指定字符的行列并生成新文件（awk命令）
摘要：如图所示，命名为file文件的表头有BP、A1、TEST等 假如想提取含有“ADD”的行和该行对应列的“BP”和"P"值，则需要用到以下命令 /ADD/表示搜索含有“ADD”的行，1表示提取第一列，7表示提取第七列，file指的是搜索的文件名，">"表示输出，file_BP_P表示输出后保存的文 阅读全文
posted @ 2016-11-01 22:12 橙子牛奶糖 阅读(2896) 评论(0) 推荐(0) 编辑
linux批量复制或删除同命名规则的文件
摘要：如图所示，有多个不同后缀的文件，但他们的前缀都是“QC_TZ.impute.” 此时想批量复制图中的文件的话，可以考虑用命令行 其中，cp表示复制，*表示不同的后缀，/your/destination/表示复制的文件存放在“destination”的文件夹下 同理，如果想批量删除的话，用以下命令行 阅读全文
posted @ 2016-11-01 21:05 橙子牛奶糖 阅读(2279) 评论(0) 推荐(1) 编辑

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