千人基因组计划数据库下载某段区域SNP
下载vcf文件:
方法一:进入ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/release/20130502/,直接下载相应染色体的vcf
方法二:进入http://grch37.ensembl.org/Homo_sapiens/Tools/DataSlicer
假定要寻找“6:133098746-133108745”这段距离的SNP数据,“6”表示6号染色体,后面的数据表示距离。
按下图所示操作:
点击“run”,进入如下界面后,再点击“view results”
弹出如下界面,再点击“Download results file”。即可得到我们要的结果
下载map文件和ped文件:
进入链接
点击后,弹出如下界面:
接着下载info文件和map文件:
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