本周最新文献速递20201128

本周最新文献速递

一

文献题目： A Single-Cell Transcriptomic Atlas of Human Skin Aging

不想看英文题目： 人类皮肤老化的单细胞转录组图谱

杂志和影响因子： Dev Cell (IF: 10.092; Q1)

研究意义： 人类的皮肤终生保持自我更新，而其衰老的明显标志是皮肤生理功能的下降。通过研究皮肤单细胞的分子和功能特性有助于了解人类皮肤老化机理。

结论：

1）对不同年龄段健康个体的眼睑皮肤进行单细胞RNA测序，鉴定了11种细胞类型、6种基底细胞亚群；

2）随着年龄增长，皮肤光老化累积、慢性炎症增加；

3）参与发育过程的转录因子在老化过程中明显变少；

4）HES1或KLF6的细胞类型特异性下调可加速衰老；

5）槲皮素促进老化的皮肤成纤维细胞再生；

文章链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33238152/

DOI: 10.1016/j.devcel.2020.11.002

二

文献题目： Common variants in signaling transcription-factor-binding sites drive phenotypic variability in red blood cell traits

不想看英文题目： 信号转录因子结合位点的常见变异驱动红细胞表型发生改变

杂志和影响因子： Nat Genet (IF: 27.603; Q1)

研究意义： 全基因组关联分析发现的大多数信号位于增强子区域，但对其如何影响增强子的分子机制了解的比较少。在这里，以红细胞（RBC）性状相关的增强子区域信号为例，阐明其生物学机制。

结论：

1）谱系特异性转录因子（MTF）和响应胞外信号的转录因子（STF）共同控制特定细胞类型的基因表达 ；

2）SMAD1 + GATA 结合区域富含特定细胞类型的谱系特异性转录因子（MTF）；

3）SMAD1 + GATA 结合区域形成转录信号中心（TSC）；

4）转录信号中心（TSC）上的响应胞外信号转录因子（STF）影响基因表达；

5）影响红细胞（RBC）性状的单核苷酸多态性（SNP）主要富集在转录信号中心（TSC）;

6）影响红细胞（RBC）性状的SNP主要位于响应胞外信号转录因子（STF）的基序中；

7）红细胞（RBC）性状相关的SNP影响STF–DNA的结合；

8）响应胞外信号转录因子（STF）上的SNP可干扰DNA结合和基因表达；

一句话总结： 对于结合在转录因子区域的红细胞（RBC）性状相关SNPs，其主要通过干扰STF的结合影响基因表达，最终影响红细胞（RBC）性状。

文章链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33230299/

DOI: 10.1038/s41588-020-00738-2

公开的资料：

GSE74483、GSE104574

公开的代码：

https://bitbucket.org/abrahamb/workspace/projects/TSC

https://github.com/BulykLab/RBCSNPs_2020

三

文献题目： A Longitudinal Epigenetic Aging and Leukocyte Analysis of Simulated Space Travel: The Mars-500 Mission

不想看英文题目： 模拟太空旅行的纵向表观老化和白细胞分析：火星-500任务

杂志和影响因子： Cell Rep (IF: 8.109; Q1)

研究意义： 研究潜在的压力源对执行太空任务的宇航员表观老化的影响。

结论：

1）任务持续时间与表观老化的显着减少有关；

2）执行任务期间，浆母细胞，CD4T，幼稚CD8和自然杀伤细胞的比例发生了显着变化；

3）执行任务后，自然杀伤细胞仍然显著减少；

文章链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33242403/

DOI: 10.1016/j.celrep.2020.108406

四 数据库介绍

文献题目： CSEA-DB: an omnibus for human complex trait and cell type associations

不想看英文题目： CSEA-DB在线数据库：人类复杂表型显著相关的细胞类型

杂志和影响因子： Nucleic Acids Res (IF: 11.501; Q1)

一句话介绍： 这个数据库主要提供与人类复杂表型显著相关的细胞类型。

文章链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33211888/

DOI: 10.1093/nar/gkaa1064

数据库网址：

https://bioinfo.uth.edu/CSEADB/

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