感兴趣的SNP/区域上是否有增强子/转录因子？增强子/转录因子调控哪个靶基因？（EnhancerDB）

前段时间毕业论文盲审，有一位盲审老师提的意见是到EnhancerDB网站看一下SNP上是否有增强子、如果有的话再看一下所在的增强子调控的靶基因是否为感兴趣的基因（真优秀，就喜欢这种直接提供干货的老师）。

于是我搜了一下EnhancerDB，看到底干嘛用的。

EnhancerDB全称是A web database to discover the regulate relationships in the context of enhancers。

网址：http://lcbb.swjtu.edu.cn/EnhancerDB/

看名字就知道这个数据库与增强子有关，简单来说，就是增强子的各种调控关系都能在这个数据库中找到。

该数据总共分为五大模块：Enhancer、TFBS、microRNA、Gene、SNP

1、Enhancer模块

这个模块可以查看某个基因片段是否有enhancer、 enhancer可能被哪些转录因子调控、enhancer上有哪些SNP位点、enhancer调控哪些基因、enhancer调控了哪些miRNA

1.1 查看某个基因片段是否有enhancer

1.2 enhancer可能被哪些转录因子调控

1.3 enhancer上有哪些SNP位点

1.4 enhancer调控哪些基因

1.5 enhancer调控了哪些miRNA

2、TFBS模块

这个模块可以查看给定的基因组上是否有转录因子结合、转录因子上有哪些SNP、转录因子调控了哪些enhancer、转录因子调控了哪些基因等。

2.1 给定的基因组上是否有转录因子结合

2.2 转录因子上有哪些SNP

2.3 转录因子调控了哪些enhancer

2.4 转录因子调控了哪些基因、miRNA

3、microRNA模块

这个模块可以查看给定的基因组上是否有miRNAs、调控miRNA的Enhancers、转录因子调控了哪些miRNAs等。

3.1 给定的基因组上是否有miRNAs

3.2 调控miRNA的Enhancers

3.3 转录因子调控了哪些miRNAs

4、Gene模块

这个模块可以查看调控基因的Enhancers、调控基因的转录因子、基因的eQTL位点等。

4.1 调控基因的Enhancers

4.2 调控基因的转录因子

4.3 基因的eQTL位点

5、SNP模块

这个模块可以查看我们感兴趣的SNP位点有哪些enhancer、转录因子、以及是哪些基因的eQTL位点等。

5.1 感兴趣的SNP位点有哪些enhancer

5.2 感兴趣的SNP位点有哪些转录因子

5.3 SNP位点是哪些基因的eQTL位点

---

今天的介绍就到这，祝各位周二愉快！