动动手指头就能查SNP和基因的突变年龄

介绍一个网站Genealogical Estimation of Variant Age (GEVA)。网址：https://human.genome.dating

看名字就知道这个网站是评估SNP位点突变年龄。

该网站是今年发表在PLoS biology的一篇文献“Dating genomic variants and shared ancestry in population-scale sequencing data”构建的。

Genealogical Estimation of Variant Age (GEVA)总共评估了4千5百万个位点的突变年龄。

使用的数据来源有TGP（包含26个群体，2504个样本）和SGDP（130个群体，278个样本），参考基因组版本均为GRCh37。

评估突变年龄采用了三个模型：1）基于突变率评估突变年龄的模型，2）基于重组率评估突变年龄，3）联合突变率和重组率评估突变年龄。

网站的使用方式很简单，就如标题的那样，动动手指头就能查询了。

如下图所示：

如果想查询SNP位点的突变年龄，在左侧红色方框输入SNP位点的dbSNP ID号，俗称的rs号即可。如果是查询基因的突变年龄，则在蓝色方框输入基因即可。

输完以后，右侧会显示三种模型下的突变年龄、均值、中值、98%置信区间年龄。以及不同参考数据下的突变年龄结果。

需要注意的是，这里的突变年龄默认情况下，单位是25年一代。