媲美GWAS Catalog，囊括45万人数据，778个表型，3千万个位点的公共数据库：GeneATLAS

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GeneATLAS的数据全部来自 UK Biobank 的452,264个英国白人样本。

总共囊括的表型有778个，位点有三千万个。

优点

网站所有关联分析的summary数据都是可以下载的。

而且提供了所有表型的原始基因型数据的曼哈顿图、imputation的曼哈段图、Q-Q Plot

可以说是相当贴心了。

缺点

不能下载原始基因型数据。

样本是欧洲群体，可能某些结果在其他群体有差异。

这个网站可以下载什么

1. 下载表型数据

比如搜索肥胖表型，会出现如下界面：

Manhattan Plot (genotyped)：

Manhattan Plot (imputed)：

Q-Q Plot：

此外，还提供了计算这个表型所用的样本信息。

比如case有多少例，control多少例。

男性和女性是否都纳入分析。

2. 下载一个或多个variants数据

见 search 栏的 by variants

3. 下载一段区域或者基因数据

见 search 栏的 by Region or Gene

4. 下载一个SNP位点的Phewas数据

见 search 栏的 Phewas

这个Phewas的意思是通过输入一个SNP位点，网站会返回这个SNP位点的所有表型的关联分析数据。

5. 下载一段区域的Phewas数据

见 search 栏的 Region Phewas

意思同4，只不过这个选项是搜索一段区域。

6. 通过P值的阈值筛选，下载数据

见 search 栏的 By significance

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好了，今天就讲到这里，赶快试一下吧，难道你不好奇你研究的遗传位点/基因对700多个表型有没有贡献吗，又或者你研究的表型的遗传位点是什么？

试试，又花不了多少时间。

GeneATLAS网站在这：

http://geneatlas.roslin.ed.ac.uk/

此篇文章感谢bio生物信息群成员王静小伙伴提供的信息。