最长公共子序列——动态规划求解

问题:例如:X={A,B,C,B,A,D,B},Y={B,C,B,A,A,C},那么,二者的最长公共子序列是{B,C,B,A},长度为4。

我们首先需要搞清楚以下两个概念:

最长公共子序列 VS 最长公共子串:

找两个字符串的最长公共子串,这个子串要求在原字符串中是连续的。而最长公共子序列则并不要求连续。

上述问题中的最长公共子序列与最长公共子串是一样的。

但是再举例X={A,B,C,B,A,D,B},Y={B,C,B,A,A,B},二者的最长公共子序列是{B,C,B,A,B},而二者的最长公共子串是{B,C,B,A}。

 

求解思路:

1.分析最优解的结构特征:

设Zk={z1,z2,z3,......zk}是Xm={x1,x2,x3,......xm}和Yn={y1,y2,y3,......yn}的最长公共子序列。

则可以得到:

若xm=yn=zk,那么Zk-1={z1,z2,z3,......zk-1}是Xm-1={x1,x2,x3,......xm-1}和Yn-1={y1,y2,y3,......yn-1}的最长公共子序列;

若xm≠yn,xm≠zk,则去除xm后,Zk={z1,z2,z3,......zk}仍然是Xm-1={x1,x2,x3,......xm-1}和Yn={y1,y2,y3,......yn}的最长公共子序列;

若xm≠yn,yn≠zk,则去除yn后,Zk={z1,z2,z3,......zk}仍然是Xm={x1,x2,x3,......xm}和Yn-1={y1,y2,y3,......yn-1}的最长公共子序列;

2.建立最优值的递归式

数据结构选择:

用c[i][j]表示Xi和Yj的最长公共子序列长度(这一步很关键,越到右下角,值会越来越大,我们最后只需要选取右下角的值就可以确定最长公共子序列的长度)

讨论:

若xi=yj=zk,那么c[i][j] = c[i-1][j-1] + 1;

若xi≠yj,xi≠zk,那么Xi需要进一步缩小一个长度进行匹配,即去除xi不影响整体的最长子序列变化,c[i][j] = c[i-1][j] ;

若xi≠yj,yj≠zk,那么Yj需要进一步缩小一个长度进行匹配,即去除yj不影响整体的最长子序列变化,c[i][j] = c[i][j-1] ;

结束条件,若i=0或者j=0,则c[i][j]=0。

所以,在xi≠yj的情况下,有两种情况,c[i][j]必等于两种情况下的最大值,即c[i][j] = max(c[i-1][j], c[i][j-1])

 

3.自底向上计算最优值,并记录最优值与最优策略

我们由上面可以知道,c[0][j]=0或者c[i][0]=0.

先使i = 1,则求x1与{y1,y2,y3,......yn}逐一比较。如图,x1≠y1,执行c[1][1] = max(c[0][1], c[1][0])  =0,接着,x1=y2,则执行,c[1][2] = c[0][1] + 1=1 ,接着,x1≠y3,则执行c[1][3] = max(c[0][3], c[1][2])  =1,......这样就求出了X1与Yn的最长公共子序列长度;

 

然后,i = 2,则建立在x1比较的基础上就可以求出{x1,x2}与{y1,y2,y3,......yn}的最长公共子序列长度;

 

然后,i = 3,建立在{x1,x2}的基础上,则可以求出{x1,x2,x3}与{y1,y2,y3,......yn}的最长公共子序列长度;

......

然后,i = m,建立在{x1,x2,......xm-1}的基础上,则可以求出{x1,x2,......xm-1}与{y1,y2,y3,......yn}的最长公共子序列长度;

4.构造最优解

在知道了最长公共子序列的长度之后,我们还需要知道最长公共子序列中都是哪些元素。我们在c[i][j]数组的右下角能够得到最长公共子序列的长度,那么,我们可以反向推出这个元素分别是什么。

由上述,我们可以得到:

若xi=yj=zk,c[i][j] = c[i-1][j-1] + 1;

若xi≠yj,xi≠zk,c[i][j] = c[i-1][j] ;

若xi≠yj,yj≠zk,c[i][j] = c[i][j-1] ;

所以,c[i][j]由上述三个等式中的一个得到,那么我们只需要记录下c[i][j]是从三个等式中哪一个得到的,那么对应的元素我们就知道了。

这样,我们就必须在借助一个数组就行保存了,我们建立新的数组b[i][j]来记录是从哪个等式中得到,即构造出下列结构。

若xi=yj=zk,c[i][j] = c[i-1][j-1] + 1,则b[i][j] = 1,那么我们就可以取出xi或者yj作为最长公共子序列中的元素;

若xi≠yj,yj≠zk,c[i][j] = c[i][j-1],则b[i][j] = 2,那么我们就可以去追踪c[i][j-1];

若xi≠yj,xi≠zk,c[i][j] = c[i-1][j] ,则b[i][j] = 3,那么我们就可以去追踪c[i-1][j];

追踪到i=0或者j=0,停止,如下图则是根据c[i][j]取值的来源将b[i][j]数组补充完整

下图为两个序列的最终比较情况:我们由上述构造b[i][j]的方法得知,若 b[i][j]= 2,那么我们去追踪c[i][j-1],若b[i][j]= 3,那么我们去追踪c[i-1][j],换言之,就是b[i][j]= 2,就往左找,b[i][j]= 3,就往右找,若b[i][j]= 1,就可以输出此时的xi或者yj

 

上面图片全部来自于 陈小玉老师的《趣学算法》,很好的一本书,值得大家看。

 

上述的思路理解清楚了,我们就可以上代码了,代码如下:

 1 #include <iostream>
 2 #include <cstring>
 3 using namespace std;
 4 const int N=1024;
 5 int c[N][N],b[N][N];
 6 char s1[N],s2[N];
 7 int len1,len2;
 8 void LCS()
 9 {
10     for(int i = 1; i <= len1; i++){
11         for(int j = 1; j <= len2; j++){
12             if(s1[i-1] == s2[j-1]){ //注:此处的s1与s2序列是从s1[0]与s2[0]开始的
13                 c[i][j] = c[i-1][j-1] + 1;
14                 b[i][j] = 1;
15             }
16             else{
17                 if(c[i][j-1] >= c[i-1][j]){
18                     c[i][j] = c[i][j-1];
19                     b[i][j] = 2;
20                 }
21                 else{
22                     c[i][j] = c[i-1][j];
23                     b[i][j] =3;
24                 }
25             }
26         }
27     }
28 }
29 
30 void LCS_PRINT(int i, int j)
31 {
32     if(i==0 || j==0){
33         return;
34     }
35     if(b[i][j] == 1){
36         LCS_PRINT(i-1,j-1);
37         cout << s1[i-1];
38     }
39     else if(b[i][j] == 2){
40         LCS_PRINT(i,j-1);
41     }
42     else{
43         LCS_PRINT(i-1,j);
44     }
45 }
46 
47 int main()
48 {
49     cout << "请输入X字符串" << endl;
50     cin >> s1;
51     cout << "请输入Y字符串" << endl;
52     cin >> s2;
53     len1 = strlen(s1);
54     len2 = strlen(s2);
55     for(int i = 0; i <= len1; i++){
56         c[i][0] = 0;
57     }
58     for(int j = 0; j <= len2; j++){
59         c[0][j] = 0;
60     }
61     LCS();
62     cout << "s1与s2的最长公共子序列的长度是:" << c[len1][len2] <<endl;
63     cout << "s1与s2的最长公共子序列是:";
64     LCS_PRINT(len1,len2);
65     return 0;
66 }

 

posted @ 2019-03-01 12:35  Halo_run  阅读(2723)  评论(0编辑  收藏  举报