Biopython 安装

参考：Biopython 安装

Biopython 安装

本节解释了如何在你的机器上安装Biopython。它的安装非常简单，不会超过5分钟。

第1步 - 验证Python的安装

Biopython被设计为与Python 2.5或更高版本一起工作。因此，必须先安装Python。在你的命令提示符下运行以下命令

> python --version

它的定义如下 –

它显示python的版本，如果安装正确的话。否则，请下载最新版本的python，安装后再运行该命令。

第2步 - 使用pip安装Biopython

在所有平台上使用pip从命令行安装Biopython是很容易的。键入下面的命令 –

> pip install biopython

在你的屏幕上将看到以下反应—

对于更新旧版本的Biopython —

> pip install biopython –-upgrade

在你的屏幕上将看到以下反应—

执行这个命令后，在安装最新版本之前，旧版本的Biopython和NumPy（Biopython依赖于它）将被删除。

第3步 - 验证Biopython的安装

现在，你已经成功地在你的机器上安装了Biopython。为了验证正确安装了Biopython，请在python控制台中输入以下命令 −

它显示了Biopython的版本。

替代方法 – 使用源代码安装Biopython

要使用源代码安装Biopython，请按照下面的说明：

 

从以下链接下载Biopython的最新版本 –https://biopython.org/wiki/Download

截至目前，最新的版本是 biopython-1.72 。

下载该文件并解压压缩档案文件，移动到源代码文件夹，并输入以下命令 –

> python setup.py build

这将从源代码中构建Biopython，如下所示-

现在，使用下面的命令测试代码 –

> python setup.py test

最后，使用下面的命令进行安装 –

> python setup.py install