rosetta Resfile语法和约束

介绍

参考:https://www.rosettacommons.org/docs/latest/rosetta_basics/file_types/resfiles

resfile包含输入到PackerTask并控制Packer的信息。简单来说,就是指定了程序运行时对特定氨基酸进行特定设计。

ALLAA: 设计为包含半胱氨酸的20种氨基酸,与ALLAAwc相同

ALLAAwc: 默认情况,设计为所有20种氨基酸

ALLAAxc: 设计为除半胱氨酸以外的其他氨基酸

POLAR: 设计为典型极性氨基酸

APOLAR: 设计为非极性氨基酸

PIKAA <list of AAs> : 设计为特定氨基酸,如PIKAA DNTP,表示将氨基酸设计为DNTP

NOTAA <list of AAs>: 不设计为指定氨基酸,如NOTAA DNTP

 

posted @ 2023-02-06 23:02  yayagogogo  阅读(137)  评论(0编辑  收藏  举报