rosetta Resfile语法和约束
介绍
参考:https://www.rosettacommons.org/docs/latest/rosetta_basics/file_types/resfiles
resfile包含输入到PackerTask并控制Packer的信息。简单来说,就是指定了程序运行时对特定氨基酸进行特定设计。
ALLAA: 设计为包含半胱氨酸的20种氨基酸,与ALLAAwc相同
ALLAAwc: 默认情况,设计为所有20种氨基酸
ALLAAxc: 设计为除半胱氨酸以外的其他氨基酸
POLAR: 设计为典型极性氨基酸
APOLAR: 设计为非极性氨基酸
PIKAA <list of AAs> : 设计为特定氨基酸,如PIKAA DNTP,表示将氨基酸设计为DNTP
NOTAA <list of AAs>: 不设计为指定氨基酸,如NOTAA DNTP