2016年1月19日
摘要: 未经本人授权禁止转载。 1 安装bowtie2 ubuntu上用bin装ok,suse上编译装的,中间包依赖有问题,可用zypper安装所需包 2 安装tophat2 ubuntu上用bin装ok,suse上执行的时候报找不到samtools,但是官网上手册说tophat2不需要samtools。。 阅读全文
posted @ 2016-01-19 14:36 cenkai 阅读(4063) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 未经本人授权禁止转载。手上有三个蛋白组,需要找到里面的ortholog,并做韦恩图。但问题在于两物种直接可能存在一对多或者多对多的同源关系,所以必须先找到三个物种里涉及哪些蛋白家族,并且各家族包括哪些基因。ortholog使用orthomcl做,基本按照网上教程来,主要需要注意1.mysql需要打开... 阅读全文
posted @ 2016-01-19 14:34 cenkai 阅读(804) 评论(0) 推荐(0) 编辑