摘要： 未经本人授权禁止转载。 1 安装bowtie2 ubuntu上用bin装ok，suse上编译装的，中间包依赖有问题，可用zypper安装所需包 2 安装tophat2 ubuntu上用bin装ok，suse上执行的时候报找不到samtools，但是官网上手册说tophat2不需要samtools。。 阅读全文

摘要： 未经本人授权禁止转载。手上有三个蛋白组，需要找到里面的ortholog，并做韦恩图。但问题在于两物种直接可能存在一对多或者多对多的同源关系，所以必须先找到三个物种里涉及哪些蛋白家族，并且各家族包括哪些基因。ortholog使用orthomcl做，基本按照网上教程来，主要需要注意1.mysql需要打开... 阅读全文

摘要： 如果报错no suitable driver found for jdbc 是spark没有合适的jdbc连接驱动，需要下一个jdbc connector的jar包放到spark路径下并把次路径放到spark/conf/spark-env.sh的SPARK_CLASSPATH里 如：export S 阅读全文

摘要： 没有授权禁止转载话说ML进化树如果要进行高bootstrap值的验证的话对于计算能力要求是很高的。不并行做基本不可能。所以下了一个RAxML，在linux下有好几种编译方式，看了一下手上的机器支持AVX指令集，所以选择AVX-MPI方式吧。先安装openmpi，照网上教程编译就行，就是略慢。但是安装... 阅读全文

摘要： 原因非常简单，我的ubuntu是64位的。所以内核文件为vmlinuz.efi，故easybcd里面启动的配置文件应该是：title Install Ubunturoot (hd0,0)kernel (hd0,0)/vmlinuz.efi boot=casper iso-scan/filename=... 阅读全文

摘要： 转自http://www.lyblog.net/detail/286.html小天地，大世界[http://www.lyblog.net]从刚开始接触CSS到现在，一般用的单位都是像素这种绝对的单位。简单方便，而且还不容易出现一些莫名其妙的问题。优点听起来不错，缺点也还是很多的，比 如说：页面缺乏灵... 阅读全文

摘要： 第一篇博客，初来乍到，欢迎交流哈。未经本人授权禁止转载。记录一下mummer做dotplot的过程：1.下载mummer，官网在http://mummer.sourceforge.net/再配环境变量，也可以直接apt-get install mummer。 如果要画图还要安装gnuplot, l... 阅读全文