2019年4月28日
摘要: # 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr1_len = 10 chr2_len = 20 chr3_len = 30 chr4_len = 40 chr5_len = 50 # 求和 total_len = chr1_len + chr2_len + chr3_len + chr4_len 阅读全文
posted @ 2019-04-28 14:57 caicai2019 阅读(229) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2019年4月23日
摘要: setwd("E:/08_cooperation/07_X-lab/06-Crosstalk/Aadapter_primer")# 读取lane01.txt,并对其按列进行相加处理,然后对列进行进行命名d1=read.table("lane01.txt",header = FALSE,sep = " 阅读全文
posted @ 2019-04-23 14:54 caicai2019 阅读(2755) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2019年3月27日
摘要: plot()是R中为对象作图的一个泛型函数(它的输出将根据所绘制对象类型的不同而变化);plot(x,y,type="b")表示将x置于横轴,y置于纵轴,绘制点集(x,y),然后使用线段将其连接;type="b"表示同时绘制点和线,使用help(plot)可以查看其它选项。 实例: > dev.ne 阅读全文
posted @ 2019-03-27 17:24 caicai2019 阅读(1769) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2019年3月14日
摘要: 使用R内置的数据框mtcars,绘制车身重量与每加仑汽油行驶的英里数的散点图,要求横轴为车身重量(wt),纵轴为每加仑汽油行驶的英里数(mpg),并添加最优拟合曲线、标题,输出为pdf文件。代码实现如下: > pdf("wt_mpg.pdf") # 开启目标图形设备,并对目标图形命名> attach 阅读全文
posted @ 2019-03-14 16:05 caicai2019 阅读(1065) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: length(object) # 显示对象中元素/成分的数量 dim(boject) # 显示某个对象的维度 str(object) # 显示某个对象的结构 class(object) # 显示某个对象的类或类型 mode(object) # 显示某个对象的模式 names(object) # 显示 阅读全文
posted @ 2019-03-14 14:50 caicai2019 阅读(209) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2019年3月13日
摘要: bat批处理,在工作中会带来很多便利。 例如:想删除多个文件夹内的文件夹“Quality”及其子文件 同时删除所有Cyc*文件夹内的所有R00*.tif文件 则可如下操作 先建立父bat文件run_del_multiple.bat,例,如下代码: ::call 子bat文件 %1 %2 %3 (在子 阅读全文
posted @ 2019-03-13 14:50 caicai2019 阅读(13784) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2019年3月5日
摘要: 变量可分为名义型变量、有序型变量或者连续型变量。名义型变量是没有顺序之分的类别变量,如糖尿病类型Diabetes(Type1、Type2),即使在数据中Type1编码为1而Type2编码为2,这也并不表示二者有序。有序变量表示一种顺序关系,而非数量关系,如病情S Status(poor、improv 阅读全文
posted @ 2019-03-05 10:04 caicai2019 阅读(1362) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2019年3月4日
摘要: > patientID<-c(1,2,3,4)> age<-c(25,34,28,52)> diabetes<-c("Type1","Type2","Type1","Type1")> status<-c("Poor","Improved","Excellent","Poor")> patientda 阅读全文
posted @ 2019-03-04 14:21 caicai2019 阅读(1578) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2019年2月27日
摘要: > #数据框可以包含不同模式(数值型、字符型、逻辑型等)的数据,是R中最常处理的数据结构。数据框可以通过函数data.frame()创建:mydata<-data.frame(coll,col2,col3,...)> #其中的列向量col1、col2、col3等可以为任何类型(如数值型、字符型或者逻 阅读全文
posted @ 2019-02-27 18:25 caicai2019 阅读(2074) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2019年2月25日
摘要: > #数组(array)与矩阵类似,但维度可大于2。可通过array函数构建,形式如下:myarray<-array(vector,dimensions,dimnames)> #其中vector包含了数组中的数据,dimensions是一个数值型向量,给出了各个维度下标的最大值,而dimnames是 阅读全文
posted @ 2019-02-25 16:33 caicai2019 阅读(329) 评论(0) 推荐(0) 编辑