2023年7月29日
摘要: 从Notepad++可以直接配置快捷键运行当前python程序。 点击 运行(R) -运行(R)... 在弹出的输入框内输入以下命令,点击 保存... 分配一个名称与快捷键,即可以按快捷键运行当前程序。 cmd /k cd /d "$(CURRENT_DIRECTORY)" & python "$( 阅读全文
posted @ 2023-07-29 01:31 caicai2019 阅读(342) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 在使用python时经常会遇到需要安装第三方库的情况,尤其是在一台新的服务器或者电脑上工作的时候。例如,在运行代码时出现下所示提示时,意思是本地没有pandas包,需要安装。此时可以在cmd终端窗口中使用pip进行安装。 Traceback (most recent call last): File 阅读全文
posted @ 2023-07-29 01:15 caicai2019 阅读(47) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2021年1月22日
摘要: 在安装好python后,有时候会根据需要安装一些python包,默认的pip源地址下载速度往往比较慢,经常会报超时错误。比较好的解决办法是修改pip默认源为国内源。国内比较靠谱的源地址有: pypi 清华大学源:https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple pyp 阅读全文
posted @ 2021-01-22 10:12 caicai2019 阅读(1435) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2020年6月10日
摘要: 在使用python for循环做数据处理时,会遇到某些文件为空,导致程序报错,可以使用dataframe.empty加if条件判断进行解决 例如: 1 data = pd.read_csv(file, skiprows=1, header=None, error_bad_lines=False) 2 阅读全文
posted @ 2020-06-10 10:26 caicai2019 阅读(19443) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 转载自:https://blog.csdn.net/soyabean555999/article/details/62235577 一、转录组还是基因组? map常用的工具有bowtie/bowtie2, BWA,SOAP1/SOAP2等。这个问题又会被分成两个问题,是基因组测序(DNA-seq)还 阅读全文
posted @ 2020-06-10 10:16 caicai2019 阅读(1660) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2020年3月3日
摘要: 想实现对多层文件中的某些指定数据的处理 如下: 一级目录 二级目录 三级目录 对所有lane文件夹下的所有cyc文件夹中的所有R001C002图像进行处理 可以使用父bat与子bat文件进行处理 子bat文件(test5.bat)代码如下: @echo off setlocal enabledela 阅读全文
posted @ 2020-03-03 13:05 caicai2019 阅读(11523) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2019年6月12日
摘要: 转自:https://www.cnblogs.com/followyourheart/articles/3349899.html 统计指标是数据分析的基本元素,变量之间的对比分析和综合分析是最基本、最常用的统计分析方法。当统计指标的量纲不同或性质不同时,如果直接用原始数据进行数据分析,往往会得到不合 阅读全文
posted @ 2019-06-12 15:48 caicai2019 阅读(2724) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2019年6月4日
摘要: 数据示例 代码实例 阅读全文
posted @ 2019-06-04 15:11 caicai2019 阅读(2749) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2019年5月15日
摘要: 提取fasta文件genome_test.fa中第14号染色体的序列,其内容如下: 用python以及命令行参数实现 新建.py文件“”GetSeqFromChrID.py”, python脚本如下: 命令行参数输入如下:红色字体是输入部分 结果如下: 阅读全文
posted @ 2019-05-15 08:56 caicai2019 阅读(2422) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2019年5月13日
摘要: 将读取文件的代码封装成函数,并使其作为模块可在其他程序运行 创建fasta_def.py文件,并输入如下代码: 新建一个test.py文件 输入如下代码调用上述模块fasta_def 阅读全文
posted @ 2019-05-13 09:59 caicai2019 阅读(1540) 评论(0) 推荐(0) 编辑