Hadoop分布式环境下的数据抽样(转)
http://dongxicheng.org/data-mining/hadoop-sampling/
1. 问题由来
Google曾经有一道非常经典的面试题:
给你一个长度为N的链表。N很大,但你不知道N有多大。你的任务是从这N个元素中随机取出k个元素。你只能遍历这个链表一次。你的算法必须保证取出的元素恰好有k个,且它们是完全随机的(出现概率均等)?
这道题的解法非常多,网上讨论也非常热烈。本文要讨论的是,这个问题是从何而来,有什么实用价值?
自从有了Hadoop之后,该问题便有了新的应用载体。随着数据量的增多,很多数据挖掘算法被转移到MapReduce上实现,而数据挖掘中有个基 本的问题是怎样对数据进行抽样。在Hadoop中,每个job会被分解成多个task并行计算,而数据的总量事先是不知道的(知道job运行结束才能获取 数总数,而数据量非常大时,扫描一遍数据的代价非常高),用户知道的只是要获取的样本量,那怎样在类似于Hadoop的分布式平台上进行数据抽样?
回过头来看google的这道面试题,是不是正好时Hadoop平台上海量数据抽样问题?
2. 在Hadoop上编写抽样程序
2.1 解法一
(1) 设计思想
蓄水池抽样:先保存前k个元素, 从第k+1个元素开始, 以1/i (i=k+1, k+2,…,N) 的概率选中第i个元素,并随机替换掉一个已保存的记录,这样遍历一次得到k个元素,可以保证完全随机选取。
(2) MapReduce实现
要实现该抽样算法,只需编写Mapper即可。在Map函数中,用户定义一个vector保存选中的k个元素,待扫描完所有元素后,在析构函数中将vector中的数据写到磁盘中。
用户运行job时,需指定每个map task的采样量。比如,用户该job的map task个数为s,则每个map task需要采集k/s个元素。
(3) 优缺点分析
由于该job没有reduce task,因而效率很高。
2.2 解法二
(1) 设计思想
依次扫描每个元素,为每个元素赋予一个随机的整数值;然后使用Top K算法(譬如最大K个整数)得到需要的K个元素。
(2) MapReduce实现
要实现该算法,用户需要编写mapper和reducer,在map函数中,为每个元素赋予一个随机数,并将该随机数作为key;在reduce函数中,每个reduce输出前k/t个元素(其中t为reduce task个数)。
(3) 优缺点分析
该算法比第一种算法低效,但由于整个过程自然流畅,实现起来非常简单,不易出错。
2.3 解法三
(1) 设计思想
考虑第一个元素,其以K/N的概率被选中;如果该节点被选中,则从剩下的(N-1)个元素中选出(K-1)个元素;如果没有被选中,则从剩下的(N-1)个元素中选出K个元素,…,依次这样下去,直到获取K个元素。
(2) MapReduce实现
用户只需编写Mapper即可。首先要获取每个map task输入的数据量,这个可以在InputFormat中计算得到。然后,在每个map函数中,采集k/s(其中s为map task数据量)个元素。
(3) 优缺点分析
由于该算法没有reduce task,效率比较高,但需要在InputFormat中统计数据量,编程复杂度较高。
3. 延伸
这个问题与《编程珠玑》上讨论的问题很相似:
输入两个整数m和n,其中m<n。输出是0~n-1范围内m个随机整数的有序表,不允许重复。
对于该问题,大致存在四种算法,他们有不同的优缺点。
(1) 第一种方法来自Knuth的《The art of Computer Programming, Volume 2: Seminumerical Algorithms》
伪代码是:
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select = m remaining = n for I = [0 n ) if (bigrand() % remaining) < select print i select— remaining— |
只要m<=n,程序选出来的整数就恰为m个。
C++的实现如下:
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void genKnuth( int m, int n) { for ( int i = 0; i < n; i++) { if (bigrand() % (n - i) < m) { cout <<i << endl; m--; } } } |
该算法非常节省空间,但需要全部扫描n个数,当n很多时,效率不高。
(2)第二种方法的复杂度只与m有关,采用了set(实际上是红黑树)节省时间。代码如下:
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void gensets( int m, int n) { set< int > S; while (S.size() < m) { S.insert(bigrand() % n); } // print S } |
该方法每次插入均在O(log m)时间内完成,但需要的空间开销很大。
(3)第三种方法克服了(2)的缺点,代码如下:
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void genshuf( int m, int n) { int i, j; int *x = new int [n]; for (i = 0; i < n; i++) { x[i] = i; } for (i = 0; i < m; i++) { j = randint(i, n-1); int t = x[i]; x[i] = x[j]; x[j] = x; } sort(x, x+m); //print result } |
该算法需要n个元素的内存空间和O(n+mlogm)的时间,其性能通常不吐Knuth的算法。
(4)当m接近n时,基于集合的算法生成的很多随机数都要丢掉,因为之前的数已经存在于集合中了,为了改进这一点,算法如下:
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void genfloyd( int m, int n) { set< int > S; set< int >::iterator i; for ( int j=n-m; j < n; j++) { int t = bigrand()%(j+1); if (S.find(t) == S.end()){ S.insert(t); // t not in S } else { S.insert(j); // t in S } } //print results } |