biostat_yu

摘要： ##简介 本文汇总一些常见的GWAS summary数据链接（定期更新） 一、GWAS汇总数据库（全表型） 1.IEU OpenGWAS：包含42,484 个GWAS摘要数据集的214,725,223,303 个遗传关联的数据库 2.PheWeb: 包含Biobank Japan，以及UKB等欧洲样 阅读全文

摘要： gsutil gsutil 是一个Python应用,该应用可通过命令行访问 Cloud Storage，本文介绍linux下的安装。 Install 安装 cd /software curl -O https://dl.google.com/dl/cloudsdk/channels/rapid/do 阅读全文

摘要： dplyr包 数据质控神器，接触R语言也4年了，一直没时间去学习这个包，最近有机会使用，有空就记录一些使用方法。 Install 安装dplyr install.packages("dplyr") Usage 分类汇总 数据格式： ups.melt <- na.omit(dd) %>% group_ 阅读全文

摘要： Human Genome Region MHC Assembly: GRCh37 Location: chr6:28,477,797-33,448,354 Cytogenetic location: 6p22.1-21.3 阅读全文

摘要： R进度条实现 发现一个包progress，可以在服务器中R实现进度条。包的地址：https://github.com/r-lib/progress install.packages("progress") library(progress) pb <- progress_bar$new(total 阅读全文

摘要： “MedSurvey”，可以用于同时存在多个中介时的p值校正 阅读全文

摘要： python /data/yxh/software/MetaXcan/software/SPrediXcan.py \ --model_db_path /data/yxh/software/MetaXcan/data/data/DGN-WB_0.5.db \ --covariance /data/y 阅读全文

摘要： ggplot2常见配色 阅读全文

摘要： https://www.jianshu.com/p/755bcc0379e0 阅读全文

摘要： 在正常使用中，发现集群中自带R为3.5.1，很多packages装不上（会出现non-zero exist报错），并且没有管理员权限，只能在子系统下安装安检，因此考虑利用Anaconda3安装新版本R语言 阅读全文