BPSO_Mynotes

摘要： Perl 中s/// 和 tr/// 的差别 说真的，要学好 perl 还真的不简单，因为 perl 的程序代码比C来得精简一半1，靠得就是在撰写时的大脑运作。程设师得花更多时间写出精简的 code，同时也要将「语意上的错误」减少到最低，这就是要靠经验的累积。废话不多说，先说s/// 置换的功能，s 阅读全文

摘要： cd 到目的目录sed -i "s/查找的内容/替换后的内容/g" `grep -rl "查找的内容" ./`参考来源：https://www.cnblogs.com/aqicheng/p/11446791.html 阅读全文

摘要： RepeatMasker软件是library-based，通过相似性比对来识别重复序列，可以屏蔽序列中转座子重复序列和低复杂度序列（默认将其替换成N）。使用数据库Dfam和Repbase The Dfam database is a collection of Repetitive DNA elem 阅读全文

摘要： 原位连接：补平产物4℃低温500g离心2min，弃上清，沉淀用1X T4连接酶buffer重悬，按照1~2 Cohesive unit/μL的连接酶用量在250μL连接体系中进行平末端连接，16℃连接4-8小时。 （连接酶的活性，浓度，反应温度和时间都有可能是影响连接效果的因素？而下面解交联后的DN 阅读全文

摘要： FileZilla软件下载网址：https://www.filezilla.cn/ 账号设置：协议 FTP文件传输协议，加密-只使用普通FTP(不安全)，登录类型-询问密码，进入NCBI指定文件夹，上传数据。 来源： http://blog.sciencenet.cn/blog-442719-113 阅读全文

摘要： C含量分布图 Per sequence GC content 这个图理论上应该符合正态分布（也就是钟形曲线），除非有过表达的序列( over-represented sequences)[也就是在正态分布的基础上有一个尖尖的峰]，或者存在其他物种的污染[也就是多个峰] 从这个图中可以看到，这个应该是 阅读全文

摘要： 长末端重复序列（long terminal repeated，LTR）：反转录病毒的基因组的两端各有一个长末端重复序列(5'—LTR和3'—LTR)，不编码蛋白质，但含有启动子，增强子等调控元件，病毒基因组内的LTR可转移到细胞原癌基因邻近处，使这些原癌基因在LTR强启动子和增强子的作用下被激活，将 阅读全文

摘要： 104c104表示两个文件都有此行，但该行有不同处107d106表示前个文件有此行，后一文件没有111a111表示后个文件有此行，前一文件没有这里数字都是行数 参考来源： https://zhidao.baidu.com/question/540299145.html 阅读全文

摘要： sed '/^\s*$/d' test.txt 参考来源：https://blog.csdn.net/abinge317/article/details/51286974 阅读全文

摘要： md5批量生成批处理脚本，无需安装任何软件，直接调用系统文件进行生成，基于windows命令编写了一个简单批量生成md5值的脚本。 使用说明： 新建文本文档，命名为get_md5.bat，直接将代码复制，保存到get_md5.bat文件中，将get_md5.bat文件复制到需要批量生成md5的文件夹 阅读全文