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摘要： 集群管理工具(SGE, Sun Grid Engine), 用于从登陆节点上向计算节点进行任务投递 SGE或者其他集群管理工作做的事情就是将用户投递的任务进行排队，然后将任务交给能够运行的计算节点执行，工作流程可以分为四步: 接受用户投放的任务 在任务运行以前，将任务放到一个存储区域 发送任务到一个 阅读全文

摘要： 这些三代全长转录组测序的相关问题，可以帮到爱学习的我哦 1.什么是三代全长转录组测序 三代全长转录组测序，即利用PacBio三代测序平台对某一物种的mRNA进行测序研究。它以平均超长读长10-15kb的优势、结合多片段文库筛选技术，实现了无需拼接的转录本分析，克服了传统二代转录组Unigene拼接较 阅读全文

摘要： 一、什么是磁盘配额 磁盘配额从字面意思上看就是给一个磁盘配置多少额度，而quota就是有多少限额的意思，所以总的来说就是限制用户对磁盘空间的使用量。因为Linux是多用户多任务的操作系统，许多人公用磁盘空间，举个例子像/home目录是存放普通用户家目录的地方，我们假如home目录一共有10G空间，而 阅读全文

摘要： 转座元件是一类能改变其自身在基因组当中的位置的DNA重复序列，它能够使得突变产生，也能“逆转”已有突变，它能改变生物细胞的遗传属性和基因组稳定性。1951年，美国冷泉港著名女性细胞遗传学家Barbara McClintock发表文章“Induction of Instability at Selec 阅读全文

摘要： 染色体倍性是指细胞内同源染色体的数目，其中只有一组的称为“单套”或“单倍体”。需要注意的是，单倍体与一倍体（体细胞含一个染色体组的个体）有区别。有的单倍体生物的体细胞中不只含有一个染色体组。 绝大多数生物为二倍体生物，其单倍体的体细胞中含一个染色体组，如果原物种本身为多倍体，那么它的单倍体的体细胞中 阅读全文

摘要： 地球纪元 中国历史上有许多朝代，每一朝代有不同君王统治。从汉朝开始，君王又各有年号，一个年号沿用一两年到几十年不等。对地质年代的划分，大体上也是这样从粗到细（当然有的皇帝特别喜欢改元，甚至一年改两次，比如公元696年是武则天治下的“万岁登封”元年和“万岁通天”元年。这种极端情况就不要追究了，本来就只 阅读全文

摘要： 一：利用pilon软件进行二代数据对三代数据polish 准备数据 ： 三代数据组装好的基因组文件：draft.fa illumina的双端测序数据经过质控之后的数据：read1_fq.gz read2_fq.gz 比对（bwa） 构建索引 $bwa index -p index/draft dra 阅读全文

摘要： 使用PAML进行分歧时间计算 PAML软件中的mcmctree命令可以使用Bayesian方法估算物种分歧时间。 对程序输入带有校准点信息的有根树、多序列比对结果，即可得到进化树各内部节点95%置信区间分歧时间信息。 PAML软件也能利用带有枝长信息的树，快速进行分歧时间计算。 1. 输入文件（1/ 阅读全文

摘要： OrthoMCL介绍 1. OrthoMCL的用途 基于序列的相似性，OrthoMCL能将一组proteins（比如全基因组的proteins）归类到ortholog groups、in-paralogs groups和co-orthologs。 2. OrthoMCL-DB OrthoMCL-DB 阅读全文

摘要： 报错提示： [amqEmbeddedWorkerJmsContainer-5] [uk.ac.ebi.interpro.scan.jms.worker.LocalJobQueueListener:204] ERROR - Execution thrown when attempting to exe 阅读全文