2020年12月28日

Heterozygosis SNP 和 Homology SNP, SNP的二态性

摘要： 纯合SNP和杂合SNP是SNP calling软件如GATK或者SAMtools根据测序深度、碱基质量值、比对质量值和基因型质量值等综合判断出来的纯合和杂合， 简单来说，纯合SNP可以认为该位点测到的所有reads只是一种碱基类型，杂合SNP为二种或二种以上的碱基类型，不排除特殊位置。 SNP一般为 阅读全文

posted @ 2020-12-28 17:28 BPSO_mynotes 阅读(3869) 评论(0) 推荐(0) 编辑

Biopython SeqIO 读取序列文件，读取信息，写入序列

摘要： Biopython 1.序列赋值 转录（反转录） 翻译 反向互补2.读取序列文件，识别序列的属性信息。 SeqRecord提供序列及其注释的容器属性： seq :一条生物序列id：基本ID，标识这条序列name：常用分子的名称description：序列分子的描述letter_annotation: 阅读全文

posted @ 2020-12-28 09:51 BPSO_mynotes 阅读(970) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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