2020年1月13日

fastqc结果中的Per sequence GC content, Sequence Duplication Levels 和 Overrepresented sequences

摘要: C含量分布图 Per sequence GC content 这个图理论上应该符合正态分布(也就是钟形曲线),除非有过表达的序列( over-represented sequences)[也就是在正态分布的基础上有一个尖尖的峰],或者存在其他物种的污染[也就是多个峰] 从这个图中可以看到,这个应该是 阅读全文

posted @ 2020-01-13 15:34 BPSO_mynotes 阅读(6537) 评论(0) 推荐(0) 编辑

LTR_FINDER

摘要: 长末端重复序列(long terminal repeated,LTR):反转录病毒的基因组的两端各有一个长末端重复序列(5'—LTR和3'—LTR),不编码蛋白质,但含有启动子,增强子等调控元件,病毒基因组内的LTR可转移到细胞原癌基因邻近处,使这些原癌基因在LTR强启动子和增强子的作用下被激活,将 阅读全文

posted @ 2020-01-13 14:32 BPSO_mynotes 阅读(2739) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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