测序的PCR duplicates及用samtools的rmdup去除PCR重复reads
摘要：
建库中有一步是： PCR扩增加了接头的DNA片段。 理想情况下，对打碎的基因组DNA，每个DNA片段测且仅测到一次。 但这一步扩增了6个cycle，那么每个DNA片段有了64份拷贝。将扩增后所有产物“洒”到flowcell，来自一个DNA片段的两个拷贝，可能会锚定在两个bead上，经过测序得到的这两 阅读全文
posted @ 2019-12-17 11:11 BPSO_mynotes 阅读(11932) 评论(0) 推荐(1) 编辑
