2019年12月4日

多行变单行

摘要: perl -pe '/^>/ ? print "\n" : chomp' in.fasta | tail -n +2 > out.fasta 参考来源: http://biotrainee.com/thread-291-1-1.html 阅读全文

posted @ 2019-12-04 22:40 BPSO_mynotes 阅读(198) 评论(0) 推荐(0) 编辑

Trimmomatic, spfilter, cutadapt

摘要: Trimmomatic主要用来去除 Illumina 平台的 Fastq 序列中的接头,并根据碱基质量值对 Fastq 进行修剪。软件有两种过滤模式,分别对应 SE 和 PE 测序数据,同时支持 gzip 和 bzip2 压缩文件。 参考来源: https://www.jianshu.com/p/7 阅读全文

posted @ 2019-12-04 11:25 BPSO_mynotes 阅读(233) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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