2019年10月18日

Vim单行复制和黏贴

摘要: 单行复制 在命令模式下,将光标移动到将要复制的行处,按“yy”进行复制 在命令模式下,将光标移动到将要粘贴的行处,按“p”进行粘贴 参考资料: https://www.cnblogs.com/EasonJim/p/8320776.html 阅读全文

posted @ 2019-10-18 11:10 BPSO_mynotes 阅读(289) 评论(0) 推荐(0) 编辑

Linux中使用gzip来压缩文件

摘要: 原文件名为file1.txt,压缩后原文件消失,压缩后文件名为file1.txt.gz gzip file1.txt 压缩两个文件到一个文件 cat file1.txt file2.txt | gzip > foo.gz 或 gzip -c file1.txt file2.txt > foo.gz 阅读全文

posted @ 2019-10-18 11:04 BPSO_mynotes 阅读(1225) 评论(0) 推荐(0) 编辑

Pacbio下机数据格式说明

摘要: RS II Sequel 在下机文件中,主要有三类文件,bam 文件,bam.pbi 文件,以及xml文件。当我们习惯性的去寻找熟悉的fastq格式文件做分析时,发现找不到了,因为在sequel平台中bam 文件成为了它的替代者,因为其更节约储存空间。这是文件格式的一个重大更新。用于后续分析的文件一 阅读全文

posted @ 2019-10-18 10:06 BPSO_mynotes 阅读(1184) 评论(0) 推荐(0) 编辑

使用wtdbg利用三代数据进行基因组de novo组装

摘要: 相较于其他三代四代数据组装软件(Canu(也可用于纠错),smartdenovo,miniasm,Flye,TULIP,FALCON,FALCON-unzip等) wtdbg有如下优点: 安装运行简单 (可用run_wtdbg_assembly.sh脚本生成运行脚本),运行速度快, 运行内容:一步组 阅读全文

posted @ 2019-10-18 09:56 BPSO_mynotes 阅读(2787) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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