核数
2020-05-14
作业队列:
- batch队列:用来提交神马集群上的串行作业或者单节并行的作业,共有十个计算节点(shenma101–shenma110),每个节点有16核,共160个计算核心。
- parallel11队列:用来提交神马集群上的并行作业,总共有51个计算(shenma11–shenma161),每个节点双路8核,共816个计算核心
- fermi队列:用来提交GPU计算
作业类型限制:
- 串行作业请使用pbs脚本提交到batch队列
- 并行作业请使用pbs脚本提交到parallel11队列
- 不允许直接在登陆节点上运行作业,发现后立即將被直接删除
- 最多可使用的计算核心数为64个
关键字 | 可选值 | 默认值 | 用途与用法 |
NCORE | 整数 | 1 | 用来同时计算一个轨道的CPU核心数。在用多核(比如32核)并行计算时,建议将该参数设置为一个计算节点的CPU核心数(比如4或8),这样一般既可提速,也会减小单核的内存压力。 |
在跑多进/线程(如iproscan/tRNAscan等)任务的时候,请添加cpu使用核数参数num_proc,避免因自己使用过多cpu而影响其它人的任务的情况发生。
使用方法:qsub -cwd -l vf=**G, -l p=**, -q ** **.sh
来源:
http://blog.sina.com.cn/s/blog_6aec0f9f0100ldt4.html
http://hpc.ipp.ac.cn/?page_id=567
http://wap.sciencenet.cn/blog-3102863-1159419.html?mobile=1
posted on 2020-07-03 17:43 BPSO_mynotes 阅读(639) 评论(0) 编辑 收藏 举报