Pacbio下机数据格式说明

RS II Sequel

在下机文件中，主要有三类文件，bam 文件，bam.pbi 文件，以及xml文件。
当我们习惯性的去寻找熟悉的fastq格式文件做分析时，发现找不到了，因为在sequel平台中bam 文件成为了它的替代者，因为其更节约储存空间。这是文件格式的一个重大更新。
用于后续分析的文件一般是.subreads.bam，这等同于RS II 中的.subreads.fastq

参考资料：