PacBio长序列纠错软件之LoRDEC

首先,利用准确度高的二代数据(NGS数据)构建简洁的de Bruijn Graph(DBG);然后,依次对每条PacBio长读长Reads进行纠错。

 

trim校正后的PacBio序列

      lordec-trim -i CorrectHQ.fa -o lordec_trimmed_reads.fa

trim和分割校正后的PacBio序列

      lordec-trim -i CorrectHQ.fa -o lordec_trimmed_reads.fa

参考来源:

https://www.jianshu.com/p/7e66ba539ddf

posted on 2019-09-06 16:34  BPSO_mynotes  阅读(500)  评论(0编辑  收藏  举报

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