Ozone数据写入过程分析

前言


上篇文章Ozone Datanode的分布式元数据管理,笔者阐述了关于Ozone Datanode的分布式元数据相关的内容以及Datanode上的数据layout。既然我们了解了Datanode上元数据的结构,那么一个很自然的问题:Datanode如何进行数据的写入的呢?里面的数据一致性是怎么做的?中间写数据发生错误,Datanode这边怎么来处理?本文我们来细聊Ozone数据写入的内部过程。

Ozone Key(文件)数据的写入


我们知道,Ozone作为对象存储系统,支持K-V模式的键值对存储,文件的数据的put操作实质上代表的key的写入。Ozone在这边是通过OM返回给客户端KeyOutputStream对象,来进行后续数据的写入的。换句话说,client是通过向OM服务申请获取目标key的KeyOutputStream,样例代码如下:

  private void writeKey(String key1, OzoneBucket bucket) throws IOException {
    OzoneOutputStream out = bucket.createKey(key1, 1024, STAND_ALONE,
        ONE, new HashMap<>());
    out.write(RandomStringUtils.random(1024).getBytes());
    out.close();
  }

OzoneOutputStream内部包装的OutputStream对象即为KeyOutputStream。

KeyOutputStream代表一个key下的数据文件,如果目标key对应要写的数据文件比较大,就可能会出现需要多block存储的情况。类似于HDFS大文件,需要多个block来存储,每个block根据offset来分隔开。在Ozone中,每个block又对应有独自的BlockOutputStream,这里每个专属的BlockOutputStream全程控制对应词block的数据写操作。

在前篇文章也提到了,Block在Ozone中是虚拟的概念,实际存储的文件叫chunk文件,一个Block由1个或多个chunk文件组成。因此BlockOutputStream的数据写出实质上是chunk文件的数据写出。BlockOutputStream内部维护了一个Chunk Buffer池做临时数据缓存,等数据达到flush触发阈值,BlockOutputStream再进行chunk文件的数据写Datanode操作。

然后执行client向Datanode发起putBlock的元数据更新操作,更新其Container db文件。此操作结束,意味着这个block数据成功地被写出Datanode中了。然后BlockOutputStream内部对应的Chunk Buffer空间也能被释放了。

上述数据的写出过程如下图所示:

在这里插入图片描述

KeyOutputStream的write方法代码如下,通过Block池创建多个BlockOutputStream进行数据的写入,

  private void handleWrite(byte[] b, int off, long len, boolean retry)
      throws IOException {
    while (len > 0) {
      // 如果当前剩余写入长度还未减少为0,则意为数据还未完全写出到Block,则继续进行循环内的数据写出
      try {
    	// 1.Block Pool新申请块进行数据的写入,返回的BlockOutputStream包装对象
        BlockOutputStreamEntry current =
            blockOutputStreamEntryPool.allocateBlockIfNeeded();
        // length(len) will be in int range if the call is happening through
        // write API of blockOutputStream. Length can be in long range if it
        // comes via Exception path.
        // 2.计算得到应写出的len数据长度,取当前BlockOutputStream和目标写入长度的最小值
        int writeLen = Math.min((int) len, (int) current.getRemaining());
        long currentPos = current.getWrittenDataLength();
        
        // 3.写出字节数据到BlockOutputStream,数据范围为字节b从offset位置后的writeLen长度
        // 此过程如果达到内部buffer触发阈值,会进行chunk的flush写出。
        writeToOutputStream(current, retry, len, b, writeLen, off, currentPos);
        // 4.如果写完这批数据后,此BlockOutputStream达到最大写入length限制,无剩余,则close此stream
        // close操作会flush出最后一个block chunk文件。
        if (current.getRemaining() <= 0) {
          // since the current block is already written close the stream.
          handleFlushOrClose(StreamAction.FULL);
        }
        // 5.更新offset和len长度值
        len -= writeLen;
        off += writeLen;
      } catch (Exception e) {
    	// 6.如果发生异常,关闭当前在写的stream
        markStreamClosed();
        throw new IOException("Allocate any more blocks for write failed", e);
      }
    }
  }

上述执行逻辑还算比较简单,新申请一个BlockOutputStream来进行数据写出,如果写满了,则进行close操作,意为此BlockOutputStream代表的block数据已经成功写出了。这里我们重点关注BlockOutputStream的异常写出情况,Ozone这边会怎么处理呢?

  private void writeToOutputStream(BlockOutputStreamEntry current,
      boolean retry, long len, byte[] b, int writeLen, int off, long currentPos)
      throws IOException {
    try {
      if (retry) {
        current.writeOnRetry(len);
      } else {
    	// 调用BlockOutputStreamEntry的write写出方法
        current.write(b, off, writeLen);
        offset += writeLen;
      }
    } catch (IOException ioe) {
       ...
      LOG.debug("writeLen {}, total len {}", writeLen, len);
      // 写出过程失败,进行异常处理
      handleException(current, ioe);
    }
  }

  private void handleException(BlockOutputStreamEntry streamEntry,
      IOException exception) throws IOException {
    Throwable t = HddsClientUtils.checkForException(exception);
    Preconditions.checkNotNull(t);
    boolean retryFailure = checkForRetryFailure(t);
    boolean containerExclusionException = false;
    if (!retryFailure) {
      containerExclusionException = checkIfContainerToExclude(t);
    }
    Pipeline pipeline = streamEntry.getPipeline();
    PipelineID pipelineId = pipeline.getId();
    // 1.获取当前stream写出成功的数据长度
    long totalSuccessfulFlushedData = streamEntry.getTotalAckDataLength();
    // 2.设置stream当前的位置
    streamEntry.setCurrentPosition(totalSuccessfulFlushedData);
    long bufferedDataLen = blockOutputStreamEntryPool.computeBufferData();
    ...
    // 3.清空当前stream内部的还未写出的buffer数据,并关闭此stream
    // 以此确保此block stream写出的数据是成功写出的数据(但不一定是满的block size的)。
    streamEntry.cleanup(retryFailure);

    ...
  }

我们可以看到,上面的逻辑确保block当前写出的数据是已经得到ack成功结果返回的数据,然后再关闭写出异常BlockOutputStream,移除其内部的chunk buffer列表。

Ozone Block(Chunk)数据的写出


下面我们继续往内部过程进行分析,来看看BlockOutputStream内部数据写出过程是怎样的。

上文已经提到过,Ozone Block数据的写出实质上是物理chunk文件的写出过程。一个文件达到Block阈值大小限制时,会产生新的Block。同理一个Block内部,如果超过一个chunk大小时,会有新的chunk文件生成。因此,Block数据的write和Key文件的write操作十分类似,代码如下:

  public void write(byte[] b, int off, int len) throws IOException {
    ...

    while (len > 0) {
      int writeLen;
      // 1.Buffer Pool分配ChunkBuffer进行数据写入
      final ChunkBuffer currentBuffer = bufferPool.allocateBufferIfNeeded(
          bytesPerChecksum);
      int pos = currentBuffer.position();
      // 2.计算目标应写入长度
      writeLen =
          Math.min(chunkSize - pos % chunkSize, len);
      // 3.往chunk buffer写入数据
      currentBuffer.put(b, off, writeLen);
      if (!currentBuffer.hasRemaining()) {
    	// 4.如果buffer数据满了,则写出buffer数据到chunk文件,调用WriteChunk请求
        writeChunk(currentBuffer);
      }
      // 5.更新offset,剩余数据长度值,已写出数据长度
      off += writeLen;
      len -= writeLen;
      writtenDataLength += writeLen;
      if (shouldFlush()) {
    	// 6.如果达到flush长度,进行block metadata的更新,调用PutBlock请求
        updateFlushLength();
        executePutBlock();
      }
      // 7.如果BufferPool满了,则进行阻塞等待,直到block数据已经成功写出,收到Datanode的ack回复
      if (isBufferPoolFull()) {
        handleFullBuffer();
      }
    }
  }

在上述过程中,只有当收到Datanode写数成功返回的Commit Index之后,BlockOutputStream才会最终清空相应应的ChunkBuffer。

  private void writeChunk(ChunkBuffer buffer)
      throws IOException {
     ...
    if (bufferList == null) {
      bufferList = new ArrayList<>();
    }
    // 加入buffer list
    bufferList.add(buffer);
    // 写出chunk数据到Datanode的Container中
    writeChunkToContainer(buffer.duplicate(0, buffer.position()));
  }
  
  private void writeChunkToContainer(ChunkBuffer chunk) throws IOException {
    int effectiveChunkSize = chunk.remaining();
    final ByteString data = chunk.toByteString(
        bufferPool.byteStringConversion());
    Checksum checksum = new Checksum(checksumType, bytesPerChecksum);
    ChecksumData checksumData = checksum.computeChecksum(chunk);
    ChunkInfo chunkInfo = ChunkInfo.newBuilder()
        .setChunkName(blockID.get().getLocalID() + "_chunk_" + ++chunkIndex)
        .setOffset(0)
        .setLen(effectiveChunkSize)
        .setChecksumData(checksumData.getProtoBufMessage())
        .build();

    try {
      // 向Datanode发起WriteChunk请求
      XceiverClientReply asyncReply =
          writeChunkAsync(xceiverClient, chunkInfo, blockID.get(), data);
      CompletableFuture<ContainerProtos.ContainerCommandResponseProto> future =
          asyncReply.getResponse();
    } catch (IOException | InterruptedException | ExecutionException e) {
      throw new IOException(
          "Unexpected Storage Container Exception: " + e.toString(), e);
    }
    ...
    // 同时加入BlockData中,此对象会在后面被PutBlock用到
    containerBlockData.addChunks(chunkInfo);
  }

WriteChunk文件后是PutBlock请求,

  private CompletableFuture<ContainerProtos.
      ContainerCommandResponseProto> executePutBlock()
      throws IOException {
    checkOpen();
    long flushPos = totalDataFlushedLength;
    Preconditions.checkNotNull(bufferList);
    final List<ChunkBuffer> byteBufferList = bufferList;
    bufferList = null;
    Preconditions.checkNotNull(byteBufferList);

    CompletableFuture<ContainerProtos.
        ContainerCommandResponseProto> flushFuture;
    try {
      // 发起PutBlock请求
    	XceiverClientReply asyncReply =
          putBlockAsync(xceiverClient, containerBlockData.build());
      CompletableFuture<ContainerProtos.ContainerCommandResponseProto> future =
          asyncReply.getResponse();
      flushFuture = future.thenApplyAsync(e -> {
          blockID.set(responseBlockID);
          ...
          // 加入<Commit Index, buffer list> 到commitWatcher中
          commitWatcher
              .updateCommitInfoMap(asyncReply.getLogIndex(), byteBufferList);
        }
        return e;
      }, responseExecutor).exceptionally(e -> {
        ...
    commitWatcher.getFutureMap().put(flushPos, flushFuture);
    return flushFuture;
  }
  public XceiverClientReply watchForCommit(long commitIndex)
      throws IOException {
    long index;
    try {
      // 阻塞等待Datanode的指定Commit Index
      XceiverClientReply reply =
          xceiverClient.watchForCommit(commitIndex, watchTimeout);
      if (reply == null) {
        index = 0;
      } else {
        index = reply.getLogIndex();
      }
      // 然后释放Commit Index的chunk buffer
      adjustBuffers(index);
      return reply;
    } catch (TimeoutException | InterruptedException | ExecutionException e) {
      // 异常处理
      releaseBuffersOnException();
      throw ioException;
    }
  }

当然在此过程中,同样可能会出现执行异常的情况导致Chunk数据写失败的情况,这边BlockOutputStream将只会释放那些已确保成功写出的Chunk数据,逻辑如下:

  // only contain data which have not been sufficiently replicated
  void releaseBuffersOnException() {
	// 获取Datanode上最近一次成功提交的Commit Index,然后释放这次commit之前的buffer
    adjustBuffers(xceiverClient.getReplicatedMinCommitIndex());
  }

  /**
   * 释放提交成功的Commit Index值之前的buffer.
   * @param commitIndex 给定的Commit Index值
   */
  private void adjustBuffers(long commitIndex) {
    List<Long> keyList = commitIndex2flushedDataMap.keySet().stream()
        .filter(p -> p <= commitIndex).collect(Collectors.toList());
    if (!keyList.isEmpty()) {
      releaseBuffers(keyList);
    }
  }

此过程的流程图如下所示:

在这里插入图片描述

这里阻塞等待Commit Index的逻辑取决于当前的Chunk Buffer是否是满的状态,如果是满的,则等待最小的Commit Index,即阻塞等待较早提交的PutBlock请求执行结束,否则等待最新(近)的PutBlock调用(最大Commit Index)结束。

  private void watchForCommit(boolean bufferFull) throws IOException {
    checkOpen();
    try {
      // 根据buffer是否是满的状态,来进行对应Commit Index的阻塞等待
      XceiverClientReply reply = bufferFull ?
          commitWatcher.watchOnFirstIndex() : commitWatcher.watchOnLastIndex();
      if (reply != null) {
        //...
      }
    } catch (IOException ioe) {
      setIoException(ioe);
      throw getIoException();
    }
  }

总结


这里我们简单总结几点以上Key数据写出的过程里,Ozone在写数据原子性上做了哪些特别的处理:

  • 多副本Pipeline里的Datanode的数据一致性通过Ratis(Raft)协议实现来保证
  • 确保每次Block写出的数据是有效的,成功的
  • 单个Block内部每次写出的Chunk数据只有被成功写出得到Datanode ack回复后,才会更新Datanode上对应的Container db文件,然后这部分数据才会被外部视为可见的数据。倘若中间block数据发生异常,中间的chunk信息也不会在Container db中存在。

因此我们可以看到,Container db的更新在这里是起到一个很关键的作用,确保了数据正确地存在于Datanode Container之上。

posted @ 2020-01-12 19:08  回眸,境界  阅读(431)  评论(0编辑  收藏  举报