摘要: https://doi.org/10.1016/j.coisb.2017.12.008 Yale university 2017年12月发布的基于机器学习中流形学习的单细胞降维降噪处理优化。 The manifold learning: 假设数据是均匀采样于一个高维欧氏空间中的低维流形,流形学习就是 阅读全文
posted @ 2018-06-18 15:05 becky_gogogo 阅读(684) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Autoencoder:机器学习中的自动编码器,这篇文章里面用的是去噪编码器,坊间称之为denoise autoencoder(DAE),在sc-RNAseq中除去dropout的噪声是非常理想的一种模型。 Therefore,这篇文章已经发表在了NC的18年预印本上,证明其方法和文章质量很是不错。 阅读全文
posted @ 2018-06-18 14:28 becky_gogogo 阅读(586) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: An accurate and robust imputation method scImpute for single-cell RNA-seq data http://jsb.ucla.edu/sites/default/files/publications/NC_scImpute.pdf 18 阅读全文
posted @ 2018-06-18 13:10 becky_gogogo 阅读(491) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Pacific BioscienceSMRTT技术。该测序也是基于边合成边测序的原理,这项技于使用了Zero-ModeWaveguide(ZMW)(零级波导)。测序的过程:被荧光标记磷酸集团的核苷酸在聚合酶活性位点上与模板链结合(每种脱氧核苷酸被不用颜色的染料标记),被激发出荧光,在荧光脉冲结束后, 阅读全文
posted @ 2018-06-18 11:12 becky_gogogo 阅读(167) 评论(0) 推荐(0) 编辑