摘要: 一、测序原理 先介绍 Nanopore 测序中的几位主角: Reader :在自然界中,有一种可以嵌入到细胞膜中作为离子或分子通道的跨膜蛋白,具有天然的蛋白纳米孔。经过人为基因工程修饰后,得到的就是 Nanopore 测序所需的 Reader 蛋白。 Membrane:Reader 蛋白会被嵌入到高 阅读全文
posted @ 2021-04-25 15:49 baimoc 阅读(5402) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 一、环境准备: 搭建 Python 高效开发环境: Pycharm + Anaconda 二、安装 scanpy pip install scanpy 三、AnnData 1、AnnData 介绍与结构 AnnData 是用于存储数据的对象,一般作为 scanpy 的数据存储格式。 主要由以下几部分 阅读全文
posted @ 2021-04-25 15:48 baimoc 阅读(2115) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: @ 介绍 开源包管理系统和环境管理系统 ,包括多种语言的包安装,运行,更新,删除,最重要的是可以解决包依赖问题 支持语言包括 Python,R,Ruby,Lua,Scala,Java,JavaScript,C / C ++,FORTRAN 支持在Windows,macOS和Linux上运行 Cond 阅读全文
posted @ 2021-04-25 15:45 baimoc 阅读(1443) 评论(1) 推荐(1) 编辑
摘要: 进入21世纪后,组学数据井喷式产出,随之而来的问题是如何处理这些数据,挖掘背后隐藏的价值。 人们想到利用包括计算机,物理学,数学,统计学在内学科的优势去解析这些大数据,随之催生出一门新的交叉学科,这就是生物信息学。 这门学科为生物进化,物种分类,育种技术,药物设计等领域起到巨大的推动作用。 不仅使我 阅读全文
posted @ 2021-04-25 12:18 baimoc 阅读(491) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 做生物信息离不开 Linux 系统,当然,更离不开Windows。但是,二者从操作到核心的不同,貌似让鱼和熊掌不可兼得。 但是!微软已经拿出了一款让鱼和熊掌兼得的方案 WSL (Windows Subsystem for Linux),也就是 Windows 系统中自带 Linux 子系统。 这比其 阅读全文
posted @ 2021-04-25 11:48 baimoc 阅读(1798) 评论(0) 推荐(1) 编辑