摘要: #R语言大小写字母转换 熊荣川 六盘水师范学院生物信息学实验室 xiongrongchuan@126.com http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz R语言有很丰富的程序包处理生物学信息及问题,如DNA等大分子数据,然后往往遇到将碱基符号在大小写字母间转化的问题,下 阅读全文
posted @ 2017-03-28 18:46 holy_black_cat 阅读(18706) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: SparkR(R on Spark)编程指南 Spark 2015-06-09 28155 1评论 下载为PDF 为什么不允许复制 关注iteblog_hadoop公众号,并在这里评论区留言并且留言点赞数排名前5名的粉丝,各免费赠送一本《大数据时代的算法:机器学习、人工智能及其典型实例》,活动截止至 阅读全文
posted @ 2017-03-28 15:58 holy_black_cat 阅读(709) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: SparkR(R on Spark)编程指南 Spark 2015-06-09 28155 1评论 下载为PDF 为什么不允许复制 关注iteblog_hadoop公众号,并在这里评论区留言并且留言点赞数排名前5名的粉丝,各免费赠送一本《大数据时代的算法:机器学习、人工智能及其典型实例》,活动截止至 阅读全文
posted @ 2017-03-28 15:57 holy_black_cat 阅读(554) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: table可统计数据的频数 tapply可根据因子、向量和要计算的函数计算 > class<-c(1,2,3,2,1,2,1,3) > class[1] 1 2 3 > c(81,65,72,88,73,91,56,90)->student> class[1] 1 2 3 2 1 2 1 3 >fa 阅读全文
posted @ 2017-03-28 13:17 holy_black_cat 阅读(578) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 一、table 函数对应的就是统计学中的列联表,是一种记录频数的方法,对于统计来说有非常重要的应用,下面的例子都是针对维数为2的情况举例,多维的情况是类似的 下面看一个例子: [html] view plain copy > ct <- data.frame( + Vote.for.X = fact 阅读全文
posted @ 2017-03-28 12:42 holy_black_cat 阅读(291) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 例如有X1,X2,..,Xn个变量,我需要对每一个变量进行频次统计,如果一个一个求解的话非常麻烦,如table(X1), table(X2), ... ,table(Xn)。有没有简单的语句一次性求解?谢谢 假定你X1,X2,...Xn都是一个data frame(df)中的列的话,那么:lapply(df, table) 阅读全文
posted @ 2017-03-28 12:41 holy_black_cat 阅读(639) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 在R语言中,常需要看哪个包加载了或是看多个相似功能的包,看到底是哪个包在起作用,通过加载和卸除后进行运行比较分析。 1、查看已加载的包 >(.packages()) 注意外面的括号和前面的点不能省。 2、卸除已加载的包 如卸除RMySQL包 >detach("package:RMySQL") 注意是 阅读全文
posted @ 2017-03-28 12:40 holy_black_cat 阅读(21603) 评论(0) 推荐(2) 编辑
摘要: R语言进行数据预处理wranging li_volleyball 2016年3月22日 data wrangling with Rpackages:tidyr dplyr 阅读全文
posted @ 2017-03-28 12:39 holy_black_cat 阅读(579) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 判断ori_data[,1]中是否存在元素a: a %in% ori_data[,1] 如果存在返回 true,否则返回 false 判断ori_data[,1]中是否存在元素a: a %in% ori_data[,1] 如果存在返回 true,否则返回 false 阅读全文
posted @ 2017-03-28 12:38 holy_black_cat 阅读(8920) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 主要学习如何把几种常用的数据格式导入到R中进行处理,并简单介绍如何把R中的数据保存为R数据格式和csv文件。1、保存和加载R的数据(与R.data的交互:save()函数和load()函数)a <- 1:10save(a, file = "data/dumData.Rdata") # data文件为 阅读全文
posted @ 2017-03-28 12:35 holy_black_cat 阅读(3554) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 之前用rvest帮人写了一个定期抓取amazon价格库存,并与之前价格比较的小程序,算是近期写过的第一个完整的程序了。里面涉及了一些报错的处理。 这里主要参考了stackoverflow上的以下问答: tryCatch部分,后续查找资料,发现以下博文: 1. R语言使用tryCatch进行简单的错误 阅读全文
posted @ 2017-03-28 11:16 holy_black_cat 阅读(1067) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Reading and writing RData files When using R, you can save and load data sets as *.rdata files. These can be easily exported and consumed using the R 阅读全文
posted @ 2017-03-28 11:15 holy_black_cat 阅读(329) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 你希望知道目前工作空间中存在哪些已定义的变量和函数。 解决方案 使用ls函数,或者使用ls.str函数了解每个变量更详细的信息。 讨论 ls函数可以显示当前工作空间中所有对象的名称:> x <- 10> y <- 50> z <- c("three", "blind", "mice")> f <- 阅读全文
posted @ 2017-03-28 11:09 holy_black_cat 阅读(13810) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 该函数和excel中的&一样,可以将不同类型的数据放在一起。 paste(....,sep="",collapse=NULL) ...表示要加在一起的数据类型,e.g ​p<-paste("b",1:5) "b 1" "b 2" "b 3" "b 4" "b 5" 注意这里每一项中间有空格隔开,如果 阅读全文
posted @ 2017-03-28 11:08 holy_black_cat 阅读(3087) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1.变量变换 as.array(x),as.data.frame(x),as.numeric(x),as.logical(x),as.complex(x),as.character(x),...转换变量类型;使用如下命令可得到全部列表,methods(as) factor():将一个向量转化为一个因 阅读全文
posted @ 2017-03-28 11:07 holy_black_cat 阅读(1286) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 最近在看《机器学习:实用案例解析》,做邮件过滤器的时候,参考书中的代码读取邮件文件进行分类器训练,在读取过程中会出现下面的错误: seq.default(which(text == "")[1] + 1, length(text), 1) : 'from' cannot be NA, NaN or 阅读全文
posted @ 2017-03-28 11:06 holy_black_cat 阅读(9870) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: ———————————————————————————————————— 1、循环 [plain] view plain copy print? ##循环for iris allzl=unique(iris$setosa) for (i in 1:2){ pp=iris[iris$setosa==a 阅读全文
posted @ 2017-03-28 11:05 holy_black_cat 阅读(4413) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: jishu <- function(x){ ifelse(x%%2 ==0,F,T)} 阅读全文
posted @ 2017-03-28 11:04 holy_black_cat 阅读(4702) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 已解决,用grep函数 A=read.table("clipboard",sep="/t",header=T) A[grep(pattern="/resource/activity",A[,1]),] 已解决,用grep函数A=read.table("clipboard",sep="/t",header=T)A[grep(pattern="/resource/activity"... 阅读全文
posted @ 2017-03-28 11:03 holy_black_cat 阅读(14671) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: objects.size() objects() 脚本举例 #将以下代码粘贴到编辑器中,另存为regression.r文件。 rate<-c(20, 22, 24, 26, 28, 30, 32, 34, 36, 38, 40, 42) impurity <-c(8.4, 9.5, 11.8, 10 阅读全文
posted @ 2017-03-28 11:02 holy_black_cat 阅读(689) 评论(0) 推荐(0) 编辑