2018年7月5日
python 去掉字符串中不想要的部分
摘要： 如果字符串是 >id1234567 但是我只需要id部分不想要‘>'怎么办？ 1. 字符串解决方法 2.正则表达式解决法 阅读全文
posted @ 2018-07-05 15:22 maxsmile17 阅读(2009) 评论(0) 推荐(0) 编辑
python 从命令行读入参数
摘要： 如何从命令行读入参数，比如希望的阈值是500 可以使用import sys，具体如下 如果有多个参数，可以继续处理，如sys.argv[2]，以此类推，也可以写一个循环 阅读全文
posted @ 2018-07-05 13:57 maxsmile17 阅读(624) 评论(0) 推荐(1) 编辑
python 直接if判断和is not None的区别
摘要： tmpName = '' if tmpName: print tmpName #没有输出 if tmpName is not None: print tmpName #有输出，是空行 阅读全文
posted @ 2018-07-05 13:47 maxsmile17 阅读(17957) 评论(0) 推荐(0) 编辑
python 正则匹配行开头为‘>’的行
摘要： 因为fasta文件格式通常为 >name1 ATGATAGTGTCTGTAGCTGACTGT AGTGCTGTAGATAGCTAGCTAGTC >name2 AGTCGATCGTAGTAGCTAGCTAGC AGTCGATGCTAGCTAGCTACGAAA 需要识别每次以'>'开头的行来区分每段编码 阅读全文
posted @ 2018-07-05 11:25 maxsmile17 阅读(2302) 评论(0) 推荐(0) 编辑
python 如何打开文件按行读取，并去掉末尾换行符
摘要： 1.按行读取 2. 去掉末尾换行符 3. 按行读取方法二 print line加逗号，可以忽略输出的换行符【python2】，在python3中可以写为 阅读全文
posted @ 2018-07-05 11:05 maxsmile17 阅读(18044) 评论(0) 推荐(1) 编辑