脱靶网站CHOPCHOP

1.脱靶网站CHOPCHOP

CHOPCHOP是用于设计基因敲除用sgRNA,还可以用来设计基于CRISPR的基因激活、沉默等,同时也是针对多种物种的。

首先在官网界面,输入基因名字或Fasta序列,选择相应的物种,然后点击运行即可搜寻候选的sgRNA

5593为例:输入基因名字、选择芝麻物种

 

 

 

结果界面:

 

 

 

选择排名第一的:TTGTGACGGAATGAGACGGGCGG

 

根据文件设计引物:

F:ATTGTTGTGACGGAATGAGACGGGCGG

R:AAACCCGCCCGTCTCATTCCGTCACAA

TTGTGACGGAATGAGACGGGCGG

CCGCCCGTCTCATTCCGTCACAA

 

posted @ 2022-09-13 08:44  ^_^Anne  阅读(4047)  评论(0编辑  收藏  举报