随笔分类 -  基因家族分析

课程笔记
摘要：1.如何下载基因组gff3文件 https://itol.embl.de/ ensembl plant -download- 2.提取cds序列 需要两个文件 ①基因组序列文件:序列 ②基因结构注释文件gff3：序列对应的结构 TBtools:GXF Sequences Extracter 首先把g 阅读全文
posted @ 2021-12-11 18:30 ^_^Anne 阅读(1019) 评论(0) 推荐(0) 编辑
基因染色体定位
摘要：1.基因染色体定位TBtools Graphics-show gene on chr-第一个 文件准备： ①染色体长度信息 ②基因位置信息 #①：染色体长度文件 用基因组序列提取每条染色体的长度信息，结果是NC_开头的基因组编号，不是染色体号 记录了每条染色体的长度信息。只要有基因组序列文件，可以使 阅读全文
posted @ 2021-12-10 10:58 ^_^Anne 阅读(5175) 评论(0) 推荐(1) 编辑

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