conda 常用命令
conda install 软件名=版本号
conda install gatk=3.7
conda create -n python2 python=2
# -n: 设置新的环境的名字
# python=2 指定新环境的python的版本,非必须参数
# 这里也可以用一个-y参数,可以直接跳过安装的确认过程。
查看已安装软件: conda list
conda env list
更新指定软件: conda update gatk
卸载指定软件:conda remove gatk
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--重命名
conda create -n tf --clone rcnn
conda remove -n rcnn --all
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----------退出环境后想用安装的 软件
export PATH="~/.soft:$PATH"
ln -s ~/miniconda3/bin/gatk ~/.soft
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退出conda环境
退出也很简单,之前我们是. ./activate 或者 (. ~/miniconda3/bin/activate)
现在退出只要:
# 或者用
conda deactivate
conda search --full --name python [列出可用的 python版本
. /usr/local/miniconda3/bin/activate p368b [source activate env_name
wget -c https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh [下载 conda
chmod 777 Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh #给执行权限
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh #运行 安装
chmod 777 activate 添加执行权限
. ./activate env_name
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/