摘要：
细胞状态（cell state）和细胞亚型（cell subtype）是两种不同的概念。一种类型的细胞，可进一步细分为不同的亚型（cell subtype），这些亚型是相对稳定的。而不同的细胞亚型受到外界刺激或扰动时，可能展现出不同的状态（cell state），这种状态是暂时。利用单细胞转录组测序（single-cell RNA-seq）技术对相应的样本进行测序后，就可基于单细胞测序数据具体研究不同细胞状态间的转换过程，中文常称作细胞轨迹的构建或拟时间序列的构建，英文叫cell trajectory/lineage and pseudotime reconstruction/inference。其中pseudotime，中文翻译为拟时间， 一种假定的时间序列。这种类型的单细胞测序数据分析，是根据细胞中基因的表达情况，将不同的细胞按照拟时间序列从开始转态、中间状态、终点状态来排列。从而能促进阐释细胞转态转换的潜在机制（更多精彩请关注微信公众号：AIPuFuBio）。 阅读全文
