决策树的可视化
前面的博客里有提到决策树,我们也了解了决策树的构建过程,如果可以可视化决策树,把决策树打印出来,对我们理解决策树的构建会有很大的帮助。这篇文章中,我们就来看下如何可视化输出一棵决策树。
一、安装相应的插件
我们需要安装Graphviz和pygraphviz,教程,这个教程里有详细的安装过程,这里就不赘述了。
二、运行实例
我们依然以iris数据集为例,打印输出决策树看下效果。
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#coding=utf-8 import numpy as np import pandas as pd import pydotplus def lrisTrain(): #预处理-引入鸢尾数据: from sklearn.datasets import load_iris iris = load_iris() from sklearn.cross_validation import train_test_split # 把数据分为测试数据和验证数据 train_data,test_data,train_target,test_target=train_test_split(iris.data,iris.target,test_size=0.2,random_state=1) #Model(建模)-引入决策树 from sklearn import tree #建立一个分类器 clf = tree.DecisionTreeClassifier(criterion="entropy") #训练集进行训练 clf.fit(train_data,train_target) #画图方法1-生成dot文件 with open('treeone.dot', 'w') as f: dot_data = tree.export_graphviz(clf, out_file=None) f.write(dot_data) #画图方法2-生成pdf文件 dot_data = tree.export_graphviz(clf, out_file=None,feature_names=clf.feature_importances_, filled=True, rounded=True, special_characters=True) graph = pydotplus.graph_from_dot_data(dot_data) ###保存图像到pdf文件 graph.write_pdf("treetwo.pdf") #进行预测 y_pred = clf.predict(test_data) #Verify(验证) #引入模块 from sklearn import metrics #法一:通过准确率进行验证 print(metrics.accuracy_score(y_true =test_target,y_pred=y_pred)) #法二:通过混淆矩阵验证(横轴:实际值,纵轴:预测值)(理想情况下是个对角阵) #print(metrics.confusion_matrix(y_true=test_target,y_pred=y_pred)) lrisTrain()
三、输出结果
上述的两个方法将会产生两个文件,一个是dot文件,我们打开这个dot文件,得到的是决策树生成的文本结构信息:
如何把它转换成树的图形结构呢?
打开一个黑窗口(cmd,Anaconda prompt...都可以),先定位到生成的决策树 treeone.dot 所在的路径下,然后输入命令行:dot -Tpdf treeone.dot -o treeone.pdf ,这样就把名为treeone.dot文件在当前目录下编译生成了treeone.pdf文件,打开后效果如下:
生成的第二个文件treetwo.pdf就可以直接打开了,效果如下:
我们生成决策树就是调用了export_graphviz函数,这个函数有很多参数值,可以通过设置这些参数值,控制生成节点上的输出信息,大家可以根据自己的需求设置参数。
小结:我们这里是用sklearn中的DecisionTreeClassifier进行分类的,构建模型的时候只用到了这一棵决策树。后面我们会将到集成学习算法xgboost算法中决策树的可视化,xgboost是直接用它自己封装的plot_tree这个类来进行输出,不需要单独安装插件,反而更加容易可视化输出决策树。