摘要：转自： https://blog.csdn.net/herokoking/article/details/79276939 Pileup 格式最初是由Sanger Institute的Tony Cox 和 Zemin Ning 使用的，描述了染色体上每个位置的碱基信息。 可以用来 SNP/indel 阅读全文
CentOS 7 上安装 Django 2.2.4，解决报错：No module named ‘_sqlite3′
2019-09-03 14:56 by 阿飞与安达, 562 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：1、首先下载最新版的sqlite ：https://www.sqlite.org/download.html 下载源码包： 配置和编译方法如下： ./configure --prefix=/usr/local/sqlite3 --disable-static --enable-fts5 --enab 阅读全文
Message: 'chromedriver' executable needs to be available in the path.
2019-09-03 13:38 by 阿飞与安达, 534 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：环境：windows10 python：3.7.3 已经把 executable.exe 添加到了环境变量中，但还是会提示以上错误。 解决办法： from selenium import webdriver driver = webdriver.Chrome("D:\software\chromed 阅读全文
CentOS 7 上CNVnator安装
2019-08-22 15:46 by 阿飞与安达, 1455 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：1、到github上下载最新版本 https://github.com/abyzovlab/CNVnator/releases 2、先看INSTALL文件，要求以下依赖，我的机器上已经安装了前两个，所以直接跳过，这里我就不提了 GNU make C compiler (e.g. gcc or cla 阅读全文
下载STRING数据库检索互作关系结果为空，但是在STRING网站却能检索出互作关系，为什么呢？？？关键词用的是蛋白ID（ENSP开头）
2019-06-18 16:36 by 阿飞与安达, 1452 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：首先介绍下两种方法： 一、本地分析 1、在STRING数据库下载人的互作文件，如下图，第一个文件 https://string-db.org/cgi/download.pl?sessionId=HGrreq5g8nLI&species_text=Homo+sapiens 2、在本地电脑上（linux 阅读全文
有基因ID或者基因名，如何拿到对应的KEGG通路图？
2019-06-18 11:49 by 阿飞与安达, 11897 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：1、https://www.kegg.jp/kegg/tool/map_pathway2.html 2、如下图，筛选出基因所在的通路，并标上不同的颜色。 3、结果页面如下，有些基因会找不到对应的通路，如下图红字，找到通路的会列在下方，点击可以查看对应通路。 阅读全文
QIIME2使用方法
2019-06-16 22:53 by 阿飞与安达, 9733 阅读, 1 推荐, 收藏, 编辑
摘要：1、数据准备 现在我们常用的就是这种格式的数据，每个样品一对数据文件 数据来源：https://docs.qiime2.org/2019.7/tutorials/importing/ 2、将数据转换为qza格式（qiime新定义的自己的格式类型，有点编程中对象的含义） 4、双端序列合并成单端 qii 阅读全文
解决git报错：error: RPC failed; curl 18 transfer closed with outstanding read data remaining 的方法
2019-05-28 09:04 by 阿飞与安达, 1222 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：报错信息： error: RPC failed; curl 18 transfer closed with outstanding read data remainingfatal: the remote end hung up unexpectedlyfatal: early EOFfatal: 阅读全文