PAML：用最大似然法分析系统发育目录1.简介 PAML能做什么 PAML不能做什么 如何运行PAML中的程序2.数据文件格式 序列文件格式 树文件格式3.Baseml 核酸替代模型 控制文件4.Basemlg5.Codeml 密码子替代模型 氨基酸替代模型 控制文件 密码子序列（seqtype =1） 氨基酸序列（seqtype = 2）6.Evolver7.Yn008.Mcmctree 简 介 化石校准 控制文件MCMCtree 和 Multidivtime 的差异 近似似然计算9.其他注释 分析大数据集和迭代算法 树形检索算法 生成引导数据集 迭代过程中的磨损记录 指定初始值 微调迭代算 Read More
Perl 有很多命令行参数。通过它可以让你的程序更简练，并且可以写出很多只有一行命令的perl。安全网参数有三个参数我认为可以起到“安全网”的作用，因为它们可以让你避免犯错，特别是当你在使用 Perl 尝试一些特别聪明（或者愚蠢）的想法时, 错误难免会发生。有经验的 Perl 程序员常常使用这三个参数来提前找到错误所在。 -C 是第一个。这个参数编译 Perl 程序但并不真正运行它。由此检查所有语法错误。每次修改 perl 程序之后我都会立刻使用它来找到任何语法错误: $ perl -c program.pl这保证了程序依然可以编译。很显然，当你输入一小段代码之后立即进行检查，比起一下子输入几 Read More
这是一个linux常见命令的列表。那些有• 标记的条目，你可以直接拷贝到终端上而不需要任何修改，因此你最好开一个终端边读边剪切&拷贝。所有的命令已在Fedora和Ubuntu下做了测试命令描述•apropos whatis显示和word相关的命令。•man -t man | ps2pdf - > man.pdf生成一个PDF格式的帮助文件which command显示命令的完整路径名time command计算命令运行的时间•time cat开始计时. Ctrl-d停止。•nice info运行一个低优先级命令（这里是info）•renice 19 -p $$使脚本运行于低优先级 Read More
一：沉稳（1）不要随便显露你的情绪。（2）不要逢人就诉说你的困难和遭遇。（3）在征询别人的意见之前，自己先思考，但不要先讲。（4）不要一有机会就唠叨你的不满。（5）重要的决定尽量有别人商量，最好隔一天再发布。（6）讲话不要有任何的慌张，走路也是。二：细心（1）对身边发生的事情，常思考它们的因果关系。（2）对做不到位的执行问题，要发掘它们的根本症结。（3）对习以为常的做事方法，要有改进或优化的建议。（4）做什么事情都要养成有条不紊和井然有序的习惯。（5）经常去找几个别人看不出来的毛病或弊端。（6）自己要随时随地对有所不足的地方补位。 三：胆识（1）不要常用缺乏自信的词句（2）不要常常反悔，轻易推 Read More
1、我年轻，需要你指点，但不需要你指指点点。2、我曾经和一个人无数次擦肩而过，衣服都擦破了，也没擦出火花。3、厌倦，就是一个人吃完盘子里的食物后对盘子的感情。4、通往成功的路，总是在施工中。5．你说吧，你是想死呢还是不想活了？6、凌晨，阳光明媚，笑脸璀璨，我赠你玫瑰，我手有余香；黄昏，枯藤老树，神色黯然，你还我玫瑰，我手有余伤。7、我娘说浪子回头金不换，谁给我金子？我换。8、这么不要脸，这么没心没肺，你的体重应该会很轻吧。9、有心娶妻，无心恋爱。10、成熟不是心变老，而是眼泪在眼里打转却还能保持微笑。11、宁愿胖得精致，也不愿瘦得雷同。12、从天堂到地狱，我只是路过人间。8、苹果最光辉的一刻就 Read More
1. 来福打电话给物业公司，说他家屋顶有点漏雨，要求派一位修理工人过来维修。修理工人很快就过来了，按来福的指引好不容易才找到那个漏洞。修理工人好奇的问：“你真细心，你是什么时候发现漏洞的？”来福皱起了眉头，说：“我也是偶尔发现的。昨天晚上，我坐在客厅喝汤，可是一连喝了两个小时，那碗汤都没喝完。”2. 一天，动物园的一只大象突然死去，饲养员赶来立即伏在大象身上痛哭起来。游客们见此情景，不由深受感动，纷纷说：“这位饲养员和这只大象的感情太深了。”不料有一人插话道：“这个动物园有个规定，如果谁饲养的动物死了，那么这个动物的墓穴就得由那个饲养员去挖，他怎能不哭呢？”3, 何四与邻居发生争执，何四便粗鲁 Read More
颜料要当偷来的用!画模特拿不住形的过去摸一摸，怕什么！去摸！不要局部，走整体，你，还有你，就局部了！同学们，不要吃静物啊。谁再吃静物我把他(她)吃了！！！（（边摆水果边再说）注意，模特是透视的，别管他穿了多少衣服。英雄，要耐得住寂寞！用肚脐眼观察 用臀大肌思考 ……打形最重要，阴影算个Ｐ黑得不够，使劲黑。用手臂，拉直线！说了好多次了，拉直线！！咱们搞艺术的人就要胆大 心细 不要脸你们别往石膏头像上画了，，好好的白眼珠都画成黑的了~~ 画得还可以，除了透视和形是错滴，其他滴都还可以……（打击啊……还有什么呢）每一张画，都是在画你自己。一张画要不停的改，改多了，改到你不能再改了。 你在来找我。注意 Read More
在second.c中还有一个函数需要调用first.c文件中的play1函数, 如何实现呢?Sencond.h 文件play1();sencond.c文件***(){Play();}例程-5在sencond.h文件内声明play1函数，怎么能调用到first.c文件中的哪个play1函数中呢? 是不是搞错了，没有搞错, 这里涉及到c语言的另一个特性:存储类说明符.C语言的存储类说明符有以下几个, 我来列表说明一下说明符 用法Auto 只在块内变量声明中被允许, 表示变量具有本地生存期.Extern出现在顶层或块的外部变量函数与变量声明中，表示声明的对象Static 具有静态生存期, 连接程序知 Read More
我们在C语言编程中会遇到一些参数个数可变的函数,例如printf()这个函数,它的定义是这样的: int printf( const char* format, ...); 它除了有一个参数format固定以外,后面跟的参数的个数和类型是可变的,例如我们可以有以下不同的调用方法: printf(\"%d\",i); printf(\"%s\",s); printf(\"the number is %d ,string is:%s\", i, s); 究 竟如何写可变参数的C函数以及这些可变参数的函数编译器是如何实现的呢?本文就这个问题 Read More
absread()读磁盘绝对扇区函数原形：int absread(int drive,int num,int sectnum,void *buf)功能：从drive指定的驱动器磁盘上，sectnum指定的逻辑扇区号开始读取(通过DOS中断0x25读取)num个(最多64K个)扇区的内容，储存于buf所指的缓冲区中。参数：drive=0对应A盘,drive=1对应B盘。返回值：0:成功；-1:失败。头文件：dos.habswrite()写磁盘绝对扇区函数原形：int abswrite(int drive,int nsects,int lsect,void *buffer) drive=0(A驱动 Read More